At give de studerende et overblik over hovedtyper af naturstoffer og proteiner som mikroorganismer og planter kan biosyntetisere, og hvorledes de kan ekstraheres og forberedes til efterfølgende kemisk analyse. Hovedformålet med kurset er at give de studerende en solid forståelse for kromatografi og analytiske metoder med særligt fokus på analyse og detektion af både kendte og ukendte stoffer ved hjælp af masse spektrometri. Kurset henvender sig til et bredt spektrum af PhD studerende indenfor især bioteknologi of sundhedsteknologi. En studerende, der fuldt ud har opfyldt kursets mål, vil kunne:

• Gøre rede for de basale principper for prøveforberedelse af små organiske molekyler og proteiner, som f.eks. fast fase ekstraktion (SPE).
• Forklare de basale principper bag kromatografi (LC, GC) herunder brug af forskellige relevante kolonne typer.
• Gøre rede for de grundlæggende principper bag diode array detektion (DAD) of masse spektrometri (f.eks. QTOF) koblet til Flydende kromatografi (LC-DAD-MS).
• Forklare betydningen af nøjagtig massebestemmelse.
• Anvende standard spektroskopisk software til dataanalyse.
• Sammenligne data fra mikrobielle ekstrakter med spektroskopisk information i "open source"databaser.
• Gøre rede for de basale principper bag kvantitativ analyse af naturstoffer (f.eks. mykotoksiner).
• Forklare principperne bag massespektrometri (f.eks. Orbitrap og MALDI TOF) baseret analyse af proteiner.
• Beskrive de grundlæggende workflow i proteomanalyser.
• Gøre rede for de forskellige metoder til kvantitative proteomanalyser, herunder med og uden brug af mærkede aminosyrer.
• Forklare de basale principper for MS-baseret proteomdataanalyse.

Industriel produktion af små organiske molekyler (herunder naturstoffer) og proteiner ved hjælp af mikrobielle cellefabrikker forventes at stige i de kommende år. Eksempler på dette er nye antibiotika, anti-cancer stoffer, små antimikrobielle proteiner og fødevare ingredienser som farvestoffer, antistoffer og vitaminer. Andre stoffer er giftige for mennesker og skal derfor undgås og kontrolleres for i mikrobielt fermenterede levnedsmidler.
Dette kursus vil gennemgå de vigtigste moderne metoder til at analysere både små molekyler og større proteiner, især baseret på væskekromatografi koblet massespektrometri. Undervisning vil være baseret på forelæsninger, opgaveløsning og gruppearbejde. Kursuspris
1) Kurset er gratis for alle ph.d.-studerende fra et dansk universitet.
2) Kursusgebyret for ph.d.-studerende registreret ved internationale universiteter: 7000 DKK.

Gebyret dækker ikke for ophold eller fortæring. 14. november, 2024