Overordnede kursusmål
Formålet med kurset er at give de studerende en indsigt i klinisk
forskning samt de udfordringer, der er forbundet med heterogent og
subjektivt vurderet data fra mennesker indlagt på en
hospitalsklinik.
Kurset vil fokusere på en søvnklinik, og de studerende vil opnå en
grundlæggende forståelse af, hvordan man optager og analyserer en
søvnoptagelse på en dansk hospitalsklinik, samt de udfordringer der
er forbundet med klinisk forskning i søvndata fra mennesker, bedømt
af mennesker. Søvn bliver i dag analyseret ved en polysomnografi,
hvor mange forskellige elektrofysiologiske signaler (blandt andet
EEG, EOG, EMG og EKG) bliver optaget simultant igennem en hel nat.
Den efterfølgende analyse af signalerne er baseret på manuel
vurdering ud fra standarder, der kan tolkes subjektivt, og derfor
ikke altid giver endegyldige svar.
Kurset vil inkludere en gennemgang af normal og unormal søvn,
hvordan søvn optages og analyseres, samt indeholde praktiske
øvelser med udstyret i en søvnklinik og klinisk data, der har til
formål at vise, hvor svært det er at opnå høj-kvalitets data, og
hvor forskelligt vi kan fortolke samme ordlyd i den nuværende
klinisk standard, der beskriver hvordan events i søvnsignaler
manuelt kan identificeres. Konkret vil øvelserne gå ud på at
identificere ”søvnspindler” i EEG’et og manuelt markere dem ifølge
en standard for derved at opbygge en database. De studerende vil
formulere egne forskningsspørgsmål og benytte databasen til
eventuelt at udvikle automatiske detektorer samt analysere
inter-rater variabilitetsmål.
Dette forskningsområde vil tydeligt illustrere udfordringerne ved
at anvende signalbehandlingsteknikker på klinisk data, og de
studerende vil lære, hvordan man formulerer klare
forskningshypoteser og præsenterer sit arbejde på en professionel
og tydelig måde.
Læringsmål
En studerende, der fuldt ud har opfyldt kursets mål, vil kunne:
- Beskrive de basale søvnmekanismer, og hvordan søvn bliver
optaget og analyseret i dag.
- Forklare nogle af de udfordringer, der er forbundet med den
nuværende måde klinisk søvndata bliver optaget og analyseret
på.
- Designe teknikker til at håndtere target vektorer for events
med høj inter-rater variabilitet.
- Diskutere og sammenligne algoritmer til automatisk detektion af
søvnspindler.
- Beregne inter-rater variabilitetsmål.
- Kritisk læse og bedømme udvalgte tidskriftsartikler og
formulere kriterier, der skal tages hensyn til, når man designer et
studie omhandlende søvnspindler.
- Formulere klare forskningshypoteser og presentere deres arbejde
på en kort, klar og professionel måde.
- Diskutere udviklingen og fremtiden for dette
forskningsområde.
Kursusindhold
Kurset vil indeholde forelæsninger (på DTU og/eller i søvnklinikken
på Rigshospitalet Glostrup), gruppearbejde og -diskussioner,
gennemgang af relevante videnskabelige artikler, og praktiske
øvelser i en søvnklinik, der vil danne grundlag for en database,
der kan arbejdes med. De studerende vil i grupper eller hver for
sig gennemgå og præsentere en artikel, og manuelt markere
søvnspindler i EEG data fra mennesker i et software program
udviklet på Rigshospitalet Glostrup.
Ved brug af den opbyggede database, vil de studerende formulere
egne forskningsmål indenfor forskningsområdet og kan eventuelt
vælge at fokusere på 1) udvikling af en algoritme til automatisk
detektion af søvnspindler, 2) beregning af diverse mål for
inter-rater variabiliteten som de kan analysere og diskutere ud
fra, eller 3) formulere og arbejde med et andet relevant
forskningsspørgsmål som tager spindel-databasen som udgangspunkt.
Kurset bedømmes ud fra en endelig poster og en mundtlig
præsentation og diskussion ud fra denne.
Litteraturhenvisninger
Slides og relevante udpegede artikler.
Bemærkninger
De praktiske øvelser bliver udført i et software program "EEG
viewer", som er udviklet på Neurofysiologisk Klinik,
Rigshospitalet Glostrup. Programmet kan kun køre på PC'er og
skal sættes op på enkelte computere på hospitalet før kursets
start. Når databasen er oprettet i software programmet, kan den
efterfølgende programmering foregå på en hvilken som helst
computer.
Sidst opdateret
05. november, 2019