At introducere et for lægemiddelindustrien essentielt redskab til lægemiddeludvikling. At udvikle et kendskab til fundamentale metoder og begreber indenfor computerbaseret lægemiddeldesign. Lære hvornår det er relevant at anvende modelleringsmetoder. Lære hvordan beregningsresultater skal fortolkes. Lære at kombinere eksperimentelle resultater med beregninger. Få erfaring med den mest anvendte software.
Læringsmål:
En studerende, der fuldt ud har opfyldt kursets mål, vil kunne:
Demonstrere kendskab til computerbaseret lægemiddeldesign og dets rolle i moderne lægemiddeludvikling
Anvende terminologien indenfor feltet
Anvende fundamentale metoder indenfor lægemiddeludvikling, såsom receptor- og farmakophorbaserede teknikker
Demonstrere kendskab til rollen af kemoinformatik i lægemiddeludvikling
Identificere targets, der er velegnede til lægemiddelterapi
Bruge krystallografiske data og NMR data i computerbaseret lægemiddeldesign
Bygge egne proteinmodeller og kritisk vurdere deres kvalitet og anvendelighed
Arbejde med UNIX-baseret software
Demonstrere kendskab til anvendeligheden af forskellige beregningsmetoder til specifikke problemstillinger
Fortolke beregningsresultater og kritisk vurdere deres kvalitet
Demonstrere førstehåndskendskab til moderne software til lægemiddeldesign
Udføre case studier på realistiske systemer med redskaber fra kurset
Kursusindhold:
Introduktion til molekylemodellering og computerbaseret lægemiddeldesign. Molekylemekanik. Konformationssøgning. Proteinstrukturer og -modellering. Metoder til lægemiddeldesign: Strukturbaseret og farmakoforbaseret. Quantitative Structure-Activity Relationship (QSAR) og metoder til beregning af fysiske egenskaber.
