Løfter den studerende fra at udvikle programmer på en personlig computer til design og implementation af life science projekter på supercomputerclustre. En studerende, der fuldt ud har opfyldt kursets mål, vil kunne:

• forbedre performance af et program ved at anvende tilegnet viden om hvordan en PC og en supercomputer virker fra et hardwaremæssigt perspektiv (ligheder og forskelle).
• designe programmer og programforløb som anvender et køsystem effektivt på varierende måder.
• evaluere effektiviteten af et program eller programforløb ved analyse af anvendelsen af IO og hukommelse.
• planlægge og implementere triviel parallel programudførsel på en node/computer.
• anvende 'Divide and Conquer' paradigmet i konkret sammenhæng med Branch&Bound kombinatorisk optimering.
• evaluere om binære og/eller probabilistiske datastrukturer kan øge performance af programmer, samt implementere disse.
• designe en database ud fra virkelige data og/eller modeller.
• anvende SQL til at forespørge og manipulere en database.
• programmere mod en relationel database i Python.
• organisere et projekt således at vejen fra rådata til resultat er tydelig og gentagelig.

Kurset løfter den studerende fra at være den eneste bruger på en enkelt computer til at være en af mange brugere på en supercomputer. Det gøres ved forelæsninger og øvelser i emner som computerarkitektur, køsystemer, parallel programmering, algoritmedesign, programoptimering, database-design og anvendelse i teori og praksis. Der anvendes forskellige life science problemstillinger i undervisningen. Kurset anvender blandt andet et computer cluster som øvelsesplatform. 02. maj, 2025