Kurset giver de studerende en integreret introduktion til analyse af proteinfamilier, funktionel annotering samt AI-assisteret enzymopdagelse og -engineering. Gennem en kombination af forelæsninger, praktiske problemløsningsopgaver og iterativt projektarbejde lærer de studerende at navigere i proteinsekvensrum, identificere funktionelle grænser, kritisk evaluere databaser, kommunikere videnskabelige resultater og forstå avancerede AI-værktøjer til udforskning (og design) af enzymer.

Aktiv deltagelse i gruppearbejde og aflevering af obligatoriske opgaver er en forudsætning for at kunne deltage i eksamen. En studerende, der fuldt ud har opfyldt kursets mål, vil kunne:

• Forklare hvordan proteinfamilier defineres, og hvordan enzymer klassificeres ved hjælp af bioinformatik og AI.
• Beskrive centrale dataressourcer og diskutere deres pålidelighed, styrker og typiske faldgruber.
• Forklare grundprincipperne for assay-udvikling, herunder laboratorieautomation.
• Fortolke videnskabelig litteratur med henblik på manuel kuratering af enzymfunktion.
• Identificere funktionelle grænser inden for proteinfamilier ved hjælp af bioinformatiske værktøjer.
• Forstå udvalgte AI-baserede værktøjer til enzymengineering.
• Analysere kvaliteten af funktionelle enzymannoteringer.
• Arbejde i teams for at analysere komplekse datasæt og kommunikere resultater klart.
• Konstruere og fortolke visuelle elementer (f.eks. dendrogrammer og andre fylogenetiske/​familieanalyseværktøjer).
• Designe og begrunde en integreret in silico-arbejdsgang til enzymopdagelse fra sekvens til funktion.
• Udarbejde en kort og præcis videnskabelig rapport om opdagelse af industrielle enzymer.

Kurset er struktureret omkring én gruppebaseret projektrapport, som er opdelt i to dele. I den første del af kurset analyserer de studerende proteinfamilier, undersøger mulige annoteringsfejl og udarbejder sekvensbaserede litteraturgennemgange baseret på en udvalgt applikationscase. I den anden del udvider de studerende deres projekt med enzymdesign, assay-udvikling og/eller design af workflow-automation.

Inviterede industriforedragsholdere og case-baseret undervisning sikrer en stærk relevans for bioteknologi og industriel enzymudvikling. 04. maj, 2026