27432 Eksperimentel eukaryot molekylærbiologi
2024/2025
Overordnede kursusmål
At give den studerende ekstensiv praktisk erfaring i
molekylærbiologisk, genetisk og fysiologisk håndtering af eukaryote
organismer.
Læringsmål
En studerende, der fuldt ud har opfyldt kursets mål, vil kunne:
- Udføre klassiske molekylærbiologiske/genetiske
eksperimenter.
- Beskrive DNA-vedligeholdelse og kromosomsegregering i eukaryote
celler. Dette inkluderer fundementale molekylære genetiske
termer.
- Håndtere gær og/eller skimmelsvampe.
- Planlægge, koordinere og udføre flere eksperimenter på samme
tid.
- Konstruere nye stammer ved 'gene targeting' og/eller
CRISPR/Cas9 gen-editering.
- Ændre et eukaryotisk genom ved at introducere punktmutationer,
deletioner, 'GFP tags' eller andre modifikationer.
- Udføre beregninger baseret på resultater fra udførte
eksperimenter.
- Analysere og fortolke eksperimentelle resultater fra de
forskellige eksperimenter udført på kurset.
- Præsentere og forklare eksperimentelle resultater opnået på
kurset foran en forsamling.
Kursusindhold
Gær og skimmelsvampe bruges ofte som modelorganismer i
grundforskning og som cellefabrikker i industrielle processer.
Dette laboratoriekursus fokuserer på at udvikle genetisk
modificerede gær og skimmelsvampestammer via klassiske
molekylærbiologiske metoder ved hjælp af moderne CRISPR-baserede
teknologier. I kurset arbejder man i små hold, der arbejder på at
udvikle deres egne nye stammer. Typisk er opgaven at deletere eller
indsætte gener i organismes genom, således at en biologisk
problemstilling efterfølgende kan belyses. De individuelle
projekter udgør derfor et mini forskningsprojekt. Med udgangspunkt
i et konkret biologisk spørgsmål, vil der blive ny lavet helt nye
stammer. Projekterne er designet, så det biologiske spørgsmål kan
adresseres via en stammekarakterisering i slutning af projektet.
Der vil typisk blive udført projekter, der er baseret på bagegær
Saccharomyces cerevisiae eller en filamentøs svamp som Aspergillus
niger. De genetiske modifikationer vil blive udført via
state-of-the-art molekylære værktøjskasser indeholdende 'bio
blocks' såsom promotorer, reportergener og terminatorer. Kurset
vil afsluttes med holdpræsentationer foran hele kursets deltagere,
hvor den biologiske problemstilling, den eksperimentelle strategi
og resultaterne gennemgås. Kurset evalueres som
bestået/ikke-bestået.
Bemærkninger
Kurset anbefales først efter kurserne 27230 og 27430.
Sidst opdateret
02. maj, 2024