27432 Eksperimentel eukaryot molekylærbiologi

2024/2025

Kursusinformation
Experimental molecular biology of eukaryotes
Engelsk
5
Kandidat
Kurset udbydes som enkeltfag
Retningsspecifikt kursus (MSc), Biotechnology
Teknologisk specialisering (MSc), Biotechnology
Juni
Campus Lyngby
Laboratorieøvelser.
3-uger
Sidste dag(e) i 3-ugersperioden
Mundtlig eksamen og bedømmelse af opgave(r)
Bedømmelsen er baseret på en helhedsvurdering af øvelsesresultater og den mundtlige fremlæggelse for alle deltagere på kursets sidste dag.
bestået/ikke bestået , intern bedømmelse
27232 og 27264
27027/27028 , Eller dokumenteret erfaring med GMO-klasse 1 organismer
27230.27430
Maksimum: 28
Uffe Hasbro Mortensen , Lyngby Campus, Bygning 223 , um@bio.dtu.dk
Jakob Blæsbjerg Hoof , Bygning 223, Tlf. (+45) 4525 2676 , jblni@dtu.dk
27 Institut for Bioteknologi og Biomedicin
I studieplanlæggeren
Kontakt underviseren for information om hvorvidt dette kursus giver den studerende mulighed for at lave eller forberede et projekt som kan deltage i DTUs studenterkonference om bæredygtighed, klimateknologi og miljø (GRØN DYST). Se mere på http://www.groendyst.dtu.dk
Overordnede kursusmål
At give den studerende ekstensiv praktisk erfaring i molekylærbiologisk, genetisk og fysiologisk håndtering af eukaryote organismer.
Læringsmål
En studerende, der fuldt ud har opfyldt kursets mål, vil kunne:
  • Udføre klassiske molekylærbiologiske/​genetiske eksperimenter.
  • Beskrive DNA-vedligeholdelse og kromosomsegregering i eukaryote celler. Dette inkluderer fundementale molekylære genetiske termer.
  • Håndtere gær og/eller skimmelsvampe.
  • Planlægge, koordinere og udføre flere eksperimenter på samme tid.
  • Konstruere nye stammer ved 'gene targeting' og/eller CRISPR/Cas9 gen-editering.
  • Ændre et eukaryotisk genom ved at introducere punktmutationer, deletioner, 'GFP tags' eller andre modifikationer.
  • Udføre beregninger baseret på resultater fra udførte eksperimenter.
  • Analysere og fortolke eksperimentelle resultater fra de forskellige eksperimenter udført på kurset.
  • Præsentere og forklare eksperimentelle resultater opnået på kurset foran en forsamling.
Kursusindhold
Gær og skimmelsvampe bruges ofte som modelorganismer i grundforskning og som cellefabrikker i industrielle processer. Dette laboratoriekursus fokuserer på at udvikle genetisk modificerede gær og skimmelsvampestammer via klassiske molekylærbiologiske metoder ved hjælp af moderne CRISPR-baserede teknologier. I kurset arbejder man i små hold, der arbejder på at udvikle deres egne nye stammer. Typisk er opgaven at deletere eller indsætte gener i organismes genom, således at en biologisk problemstilling efterfølgende kan belyses. De individuelle projekter udgør derfor et mini forskningsprojekt. Med udgangspunkt i et konkret biologisk spørgsmål, vil der blive ny lavet helt nye stammer. Projekterne er designet, så det biologiske spørgsmål kan adresseres via en stammekarakterisering i slutning af projektet. Der vil typisk blive udført projekter, der er baseret på bagegær Saccharomyces cerevisiae eller en filamentøs svamp som Aspergillus niger. De genetiske modifikationer vil blive udført via state-of-the-art molekylære værktøjskasser indeholdende 'bio blocks' såsom promotorer, reportergener og terminatorer. Kurset vil afsluttes med holdpræsentationer foran hele kursets deltagere, hvor den biologiske problemstilling, den eksperimentelle strategi og resultaterne gennemgås. Kurset evalueres som bestået/​ikke-bestået.
Bemærkninger
Kurset anbefales først efter kurserne 27230 og 27430.
Sidst opdateret
02. maj, 2024