23263 Avanceret modellering af infektionssygdomme

2024/2025

Studerende på kandidatuddannelsen "Infectious Disease Health Informatics" har fortrinsret på dette kursus.
Kursusinformation
Advanced modeling of infectious diseases
Engelsk
5
Kandidat
Retningsspecifikt kursus (MSc), Bioinformatics
E2A (man 13-17)
Campus Lyngby
Ugentlige forelæsninger og øvelsestimer
13-uger
E2A
Mundtlig eksamen
Ingen hjælpemidler
7-trins skala , intern bedømmelse
0100522113 , Matematik 1 (eller tilsvarende) Unix & Python (eller tilsvarende)
Minimum 10 Maksimum: 25
Christian Brinch , Lyngby Campus, Bygning 204 , cbri@food.dtu.dk
23 Fødevareinstituttet
I studieplanlæggeren
Overordnede kursusmål
Dette kursus giver en grundig indføring i epidemiologisk modellering. Studerende lærer en bred vifte af teknikker som kan bruges til at analysere udbrud og forudsige udviklingen af epidemier. Kurset fokuserer på en matematisk beskrivelse af sygdomsmodellerne og der bruges Python til at udvikle og løse modellerne.
Læringsmål
En studerende, der fuldt ud har opfyldt kursets mål, vil kunne:
  • Genkend leddene i SIR modellen og afledte modeller
  • Tilpas en simple model til en given epidemi
  • Vælg den passende modeltype til et givent udbrud
  • Løs en tids-afhængig epidemiologisk model numerisk
  • Fit modelparametre til epidemiologiske data
  • Forklar effekten af støj i epidemiologiske data
  • Forklar effekten af sæsonvariation og andre tidsafhængige led
  • Udled den endemiske ligevægtsløsning for en given model
  • Beregn hastigheden af en epidemi ud fra en rumlig model
  • Analyser epidemier ud fra netværksbaserede modeller
Kursusindhold
Dynamiske systemer, stabilitetsanalyse, ikke-lineær dynamik og kaos. Temporale modeller (SIR). Risikostrukturer. Mulit-vært/​multi-pathogen modeller. Drevne modeller, Tilfældig dynamik og modeller med støj, agen-baserede modeller. Rumlige modeller, netværksmodeller og meta-populationer. Sygdomskontrol og forebyggelse. Global mobilitet, pandemier, økonomisk epidemiologi og antibiotikaresistens.
Litteraturhenvisninger
"Modeling Infectious Disease in Humans and Animals", Keeling and Rohani, Princeton Press
Sidst opdateret
02. maj, 2024