27820 Mikrobielle biofilmteknikker

2023/2024

Ph.d.-kursus 8 dage i august hvert år.
Kursusinformation
Microbial biofilm techniques
Engelsk
5
Ph.d., Fagligt fokuseret kursus
Kurset udbydes som enkeltfag
August
8 dage i august hvert år.
Campus Lyngby
8 dage med intensivt laboratoriearbejde og forelæsninger af inviterede foredragsholdere. Aftensessioner. Kurset løber over 8 sammenhængende dage inkl. weekenddage.
[Kurset følger ikke DTUs normale skemastruktur]
Ved kursets afslutning.
Mundtlig eksamen
Mundtlig præsentation af resultater.
Alle hjælpemidler er tilladt
bestået/ikke bestået , intern bedømmelse
27254
Et grundlæggende kendskab til mikrobiologi og laboratoriearbejde.
Minimum 6 Maksimum: 15
Claus Sternberg , Lyngby Campus, Bygning 221, Tlf. (+45) 4525 2770 , cst@bio.dtu.dk
Janus Anders Juul Haagensen, Stanford University, USA , jajh@biosustain.dtu.dk
27 Institut for Bioteknologi og Biomedicin
Hos underviser
fra 1.3. til 1.6.
Mail til Claus Sternberg, cst@bio.dtu.dk. Kvalificerede tilmeldte vil blive accepteret løbende, indtil kurset er fuldt.
Overordnede kursusmål
Kursets overordnede mål er at give de studerende en grundig gennemgang af forskellige metodikker for biofilmdyrkning og analyse.

Deltagerne vil desuden have opnået kendskab til den generelle fysiologi af bakterier, der vokser som biofilm og specielle problemstillinger i forbindelse med behandling af patienter, der er inficeret med bakterier, der vokser som biofilm.
Læringsmål
En studerende, der fuldt ud har opfyldt kursets mål, vil kunne:
  • Opstille biofilm-flowcelleforsøg og udføre disse: Manipulation og monitoring af levende biofilm, antibiotika behandling af biofilm, viabilitetsmåling, on-line målinger af ilt i biofilm, høstning af biofilm.
  • Udføre biofilm mikrotiterbakke-assay.
  • Anvende avancerede optiske mikroskopiteknikker: Konfokal-mikroskopi og fluorescens-mikroskopi, time-lapse (konfokal) mikroskopi.
  • Udføre Fluorescence In Situ Hybridisering (FISH) på embeddede biofilm.
  • Udføre enkle biofilmforsøg med en ukendt organisme som deltagerne selv medbringer eller isolerer på stedet.
  • Udføre matematisk billedbehandling ved COMSTAT-analyse.
  • Udføre digital billedpræparation og præsentation (Imaris).
  • Præsentere biofilmresultater for en forsamling.
Kursusindhold
Kurset er fokuseret på biofilm i en medicinsk kontekst med eksempler fra urinvejsinfektioner til cystisk fibrose. Teknikkerne inkluderer opsætning og kørsel af biofilm-flowcellesystemer, fluorescence in situ hybridisering, forskellige former for avanceredet afbildning, flowcytometri med mere. Kurset vil være praktisk med øvelser suppleret med forelæsninger af fremtrædende forskere inden for felterne medicinsk mikrobiologi og mikrobielle biofilm. Kursusindholdet kan variere en smule fra år til år.
Bemærkninger
Ved overtegning gives prioritet til ph.d.-studerende

Kursuspris
1) Ph.d.-studerende: Kurset er gratis for alle ph.d.-studerende fra Danmark og andre EØS-lande. Ph.d.-studerende betaler dog 1.500 kr for udgiften til kursusmaterialer.
2) Academia: 7.000 kr
3) Industri og andre: 15.000 kr

Gebyret dækker ikke ophold eller fortæring.
Sidst opdateret
13. februar, 2024