29902 Videregående Eksperimentel Syntetisk Biologi for Cellefabrikker

2022/2023

Kurset er arrangeret af Novo Nordisk Foundation Center for Biosustainability og vil finde sted på Centerets laboratorier i bygning 220. Master studerende kan også tage kurset.
Kursusinformation
Advanced Experimental Synthetic Biology for Cell Factories
Engelsk
5
Ph.d., Fagligt fokuseret kursus
Kurset udbydes som enkeltfag
Juni
Kurset finder sted fra den 1. til den 22. juni 2023
DTU Biosustain, bygn 220
Eksperimentelt arbejde, dataanalyse, gruppearbejde, forelæsninger og projektarbejde
3-uger
Sidste dag(e) i 3-ugersperioden
Mundtlig eksamen
Præsentation af projekt
Alle hjælpemidler er tilladt
bestået/ikke bestået , intern bedømmelse
27750
27750
27027
27026/27611/27405 , 27026 - Teoretisk molekylær mikrobiologi 27611 - Introduktion til bioinformatik 27405 - Cellefabrikker: Design, konstruktion og analyse
Minimum 12 Maksimum: 25
Pablo Ivan Nikel , Lyngby Campus, Bygning 220 , pabnik@biosustain.dtu.dk
Christoph Daniel Volke , Lyngby Campus, Bygning 220 , chdavo@biosustain.dtu.dk
Emil Damgaard Jensen , Lyngby Campus, Bygning 220 , emdaje@biosustain.dtu.dk
29 DTU Biosustain
I studieplanlæggeren
Dette kursus giver den studerende en mulighed for at lave eller forberede et projekt som kan deltage i DTUs studenterkonference om bæredygtighed, klimateknologi og miljø (GRØN DYST). Se mere på http://www.groendyst.dtu.dk
Overordnede kursusmål
At give studerende en omfattende teoretisk viden og praktisk erfaring med moderne syntetisk biologi, beregningsbiologi og stofskifte design til udvikling af industrielle cellefabrikker.
Læringsmål
En studerende, der fuldt ud har opfyldt kursets mål, vil kunne:
  • Udvælge en passende cellefabrik, kulstofkilde, samt fermenteringsproces for at fremstille et bioprodukt, baseret på en teknisk-økonomisk analyse.
  • Designe en biosyntetisk rute ved at bruge bioinformatiks værktøj og databaser.
  • Designe strategier for et stammeoptimeringsprogram.
  • Designe genetiske modificeringer af fem populær cellefabrikker (E. coli, S. cerevisiae, P. putida, Streptomyces, CHO) in silico ved at anvende en moderne syntetisk biologi-værktøjskasse (CRISPR-Cas9, USER, Gibson, in vivo recombination, RNA interference, osv.)
  • Anvende syntetisk biologi værktøj for at gennemføre genetisk modificering af en cellefabrik i laboratoriet.
  • Følge God laboratoriepraksis (GLP): registrere data i Laboratory Information Management System (LIMS) og føre en elektronisk laboratoriebog.
  • Analysere og fortolke eksperimentelle resultater.
  • Præsentere det udførte eksperimentelle studie.
Kursusindhold
Deltagerne lærer at anvende state-of-the-art syntetisk biologi værktøjer til at designe effektive cellefabrikker til biobaseret produktion af værdiskabende stoffer, hvilket inkluderer alle aspekter af design-build-test-learn cyklussen. Kurset består af teoretisk undervisning om formiddagene og laboratoriearbejde om eftermiddagene. Deltagerne kommer til at arbejde i mindre grupper på de forskellige eksperimentelle forløb, hvor de vil udføre et forskningsprojekt gående på stammebygning af P. putida, Streptomyces, S. cerevisiae eller in vitro proteinmodificering.
Sidst opdateret
01. juni, 2023