Det overordnede formål med dette kursus er at give de studerende et uddybende kendskab til: i) biosyntese af forskellige typer af komplekse små organiske molekyler (sekundære metabolitter = naturstoffer); ii) de forskellige typer af enzymer, som katalyserer biokemiske reaktioner, samt; iii) opbygningen af sekundære metabolit kodende genklustre, og iv) hvorledes man kan bruge bioinformatiske metoder til at koble viden om gener til kemiske strukturer og omvendt. En studerende, der fuldt ud har opfyldt kursets mål, vil kunne:

• Forstå og kunne redegøre for biosyntese af polyketider.
• Forstå og kunne redegøre for biosyntese af ribosomale og non-ribosomale peptider.
• Forstå og kunne redegøre for biosyntese af terpener, og naturstoffer af blandet biosyntetisk oprindelse.
• Forudsige sammensætningen af det relaterede genkluster, i både bakterier og svampe, baseret på strukturel analyse af en given kemisk struktur.
• Forstå og kunne anvende bioinformatiske metoder som AntiSMASH til analyse af sekundære metabolit genklustre.
• Forstå de bagved liggende principper og anvendelsen af bioinformatiske metoder som BLAST, HMMer, Interproscan til at forudsige typer af relaterede enzym aktiviteter.
• Forstå og kunne redegøre for opbygningen og domæne strukturer i polyketid syntaser og non-ribosomale peptide synthetaser
• Forudsige typer af naturstoffer og deres biosyntese baseret på analyse af genomdata.

Avanceret forståelse for biosyntese af komplekse naturstoffer som polyketider, non-ribosomale peptider, terpener og stoffer af blandet biosyntetisk oprindelse. Anvendelse af bioinformatisk baserede analyse metoder, som AntiSMASH til annotering af de gener (og klustre), der ligger til grund for de mange typer af enzymkatalyserede reaktioner, der er involveret i biosyntese af naturstoffer. Kurset henvender sig til både biotek og kemi studerende, der gerne vil udvide deres biokemiske kompetencer, og er interesseret i ”naturens organiske kemi”. 03. maj, 2022