27255 Avanceret eksperimentel prokaryot molekylærbiologi og –økologi

2022/2023

Kursusinformation
Advanced experimental prokaryotic molecular biology and ecology
Engelsk
5
Kandidat
F5B (ons 13-17)
Campus Lyngby
Forelæsninger, laboratorieøvelser, gruppearbejde
13-uger
F5B
Bedømmelse af øvelser og rapport(er)
Bedømmelsen er baseret på en helhedsvurdering af en posterpræsentation samt en laboratorierapport
7-trins skala , intern bedømmelse
27254
27254
27028 , eller lignende
27026 , At have kendskab til mikrobiel biodiversitet samt bakteriel genetik og fysiologi på et niveau, der er gør det muligt at læse, diskutere og evaluere videnskabelig litteratur.
Minimum 10 Maksimum: 20
Lars Jelsbak , Lyngby Campus, Bygning 221, Tlf. (+45) 4525 6129 , lj@bio.dtu.dk
Akos Tibor Kovács , Tlf. (+45) 4525 2527 , atkovacs@dtu.dk
27 Institut for Bioteknologi og Biomedicin
I studieplanlæggeren
Dette kursus giver den studerende en mulighed for at lave eller forberede et projekt som kan deltage i DTUs studenterkonference om bæredygtighed, klimateknologi og miljø (GRØN DYST). Se mere på http://www.groendyst.dtu.dk
Overordnede kursusmål
Kurset fokuserer på eksperimentelle teknikker indenfor bioteknologi-relevante områder af bakteriologi og molekylær mikrobiologi. I kurset vil du arbejde med både nye teknologier i molekylær økologi, syntetisk biologi samt metoder til at udnytte eller kontrollere den bakterielle biodiversitet, der findes i naturen.
I løbet af kurset vil du:
- Anvende avancerede værktøjer, modeller og metoder indenfor molekylær mikrobiologi og økologi.
- kritisk evaluere eksperimentelle resultater og hypoteser.
Samlet set har kurset til formål at give dig kompetencer, der giver dig mulighed for at designe, udvikle, bruge eller forbedre bakteriesystemer til bioteknologiske anvendelser indenfor biokontrol, bioproduktion og medicinske scenarier.
I øjeblikket er kurset fokuseret på mikrobielle isolater med biokontrol eller biogødningspotentiale i landbrugsapplikationer
Læringsmål
En studerende, der fuldt ud har opfyldt kursets mål, vil kunne:
  • Vælge en relevant strategi til dyrkning af specifikke bakterier fra miljøprøver.
  • Identificere mikroorganismer ved brug af molekylære biologiske metoder.
  • Designe en screeningsproces fra f.eks. isolering af en bioaktiv bakterie til identifikation af et aktivt molekyle.
  • Analysere naturlige mikrobielle samfund ved hjælp af sekvensbaserede molekylære metoder.
  • Bruge bioinformatiske værktøjer til at analysere 16S rRNA-sekvenser og andre gensekvenser.
  • Analysere aktivitet og organisering af bakterier i in vitro mikrobielle samfund og biofilm.
  • Bruge avancerede mikroskopi metoder, herunder konfokal mikroskopi.
  • Anvende syntese biologiske værktøjer til at analysere genfunktioner og mikrobielle fænotyper og processer.
  • Anvende evolutionære metoder til at analysere genfunktioner samt optimering af fænotyper.
  • Evaluere, vælge og anvende den mest passende teknik(er) til at teste en hypotese.
  • Fremlægge en metode anvendt i kurset samt de opnåede resultater.
Kursusindhold
Kurset er baseret på aktiv deltagelse i laboratorieøvelser. Dette omfatter praktisk arbejde i laboratoriet, forberedelse før undervisning, databehandling og fortolkning, præsentation af resultater i plenum samt skrivning af rapport. Det omfatter også at tilegne sig den teoretiske baggrund, der ligger til grund for de anvendte metoder og værktøjer, ud fra undervisningsmaterialet og fra den videnskabelige litteratur.
Litteraturhenvisninger
Laboratoriemanualer samt videnskabelige artikler
Bemærkninger
Dette er et 13-ugers eksperimentelt kursus, der kræver aktiv ugentlig deltagelse. Normalt er der mange flere studerende, der tilmelder sig kurset, end vi har ledige pladser. Tilmeld dig derfor kun dette kursus, hvis du kan forpligte dig til dette, og hvis du er stærkt motiveret af emnet.
Sidst opdateret
03. maj, 2022