Overordnede kursusmål
Kurset fokuserer på eksperimentelle teknikker indenfor
bioteknologi-relevante områder af bakteriologi og molekylær
mikrobiologi. I kurset vil du arbejde med både nye teknologier i
molekylær økologi, syntetisk biologi samt metoder til at udnytte
eller kontrollere den bakterielle biodiversitet, der findes i
naturen.
I løbet af kurset vil du:
- Anvende avancerede værktøjer, modeller og metoder indenfor
molekylær mikrobiologi og økologi.
- kritisk evaluere eksperimentelle resultater og hypoteser.
Samlet set har kurset til formål at give dig kompetencer, der giver
dig mulighed for at designe, udvikle, bruge eller forbedre
bakteriesystemer til bioteknologiske anvendelser indenfor
biokontrol, bioproduktion og medicinske scenarier.
I øjeblikket er kurset fokuseret på mikrobielle isolater med
biokontrol eller biogødningspotentiale i landbrugsapplikationer
Læringsmål
En studerende, der fuldt ud har opfyldt kursets mål, vil kunne:
- Vælge en relevant strategi til dyrkning af specifikke bakterier
fra miljøprøver.
- Identificere mikroorganismer ved brug af molekylære biologiske
metoder.
- Designe en screeningsproces fra f.eks. isolering af en bioaktiv
bakterie til identifikation af et aktivt molekyle.
- Analysere naturlige mikrobielle samfund ved hjælp af
sekvensbaserede molekylære metoder.
- Bruge bioinformatiske værktøjer til at analysere 16S
rRNA-sekvenser og andre gensekvenser.
- Analysere aktivitet og organisering af bakterier i in vitro
mikrobielle samfund og biofilm.
- Bruge avancerede mikroskopi metoder, herunder konfokal
mikroskopi.
- Anvende syntese biologiske værktøjer til at analysere
genfunktioner og mikrobielle fænotyper og processer.
- Anvende evolutionære metoder til at analysere genfunktioner
samt optimering af fænotyper.
- Evaluere, vælge og anvende den mest passende teknik(er) til at
teste en hypotese.
- Fremlægge en metode anvendt i kurset samt de opnåede
resultater.
Kursusindhold
Kurset er baseret på aktiv deltagelse i laboratorieøvelser. Dette
omfatter praktisk arbejde i laboratoriet, forberedelse før
undervisning, databehandling og fortolkning, præsentation af
resultater i plenum samt skrivning af rapport. Det omfatter også at
tilegne sig den teoretiske baggrund, der ligger til grund for de
anvendte metoder og værktøjer, ud fra undervisningsmaterialet og
fra den videnskabelige litteratur.
Litteraturhenvisninger
Laboratoriemanualer samt videnskabelige artikler
Bemærkninger
Dette er et 13-ugers eksperimentelt kursus, der kræver aktiv
ugentlig deltagelse. Normalt er der mange flere studerende, der
tilmelder sig kurset, end vi har ledige pladser. Tilmeld dig derfor
kun dette kursus, hvis du kan forpligte dig til dette, og hvis du
er stærkt motiveret af emnet.
Sidst opdateret
03. maj, 2022