27024 Life science øvelser og dataanalyse I: Biokemi

2022/2023

Deltagerne skal selv medbringe egen kittel og sikkerhedsbriller.
Kursusinformation
Life science exercises and data analysis I: Biochemistry
Engelsk
5
Bachelor
F4A (tirs 13-17)
F5B (ons 13-17) eller
F1B (tors 13-17)
Skemaplacering er som følger:
Life Science Engineering: Tirsdag, Onsdag og Torsdag
General Engineering: Torsdag
Andre: fordeles på ledige pladser
Campus Lyngby
Laboratorieøvelser med teoretisk statistik undervisning og regneøvelser, der integrer det biokemiske med det statistiske faglige indhold
13-uger
Bedømmelse af øvelser og rapport(er)
Godkendelse af rapporter, obligatoriske laboratorieøvelser, samt obligatoriske statistik quizzer, baseret på en helhedsvurdering.
Alle hjælpemidler er tilladt
bestået/ikke bestået , intern bedømmelse
27023
27002/27008 , Eller tilsvarende. Det anbefales på det kraftigste at tage 27022 Biokemi eller lignende samtidig med eller før dette kursus. Studerende, der undlader dette, skal være forberedt på at bruge væsentlig mere tid på at erhverve den teoretiske baggrund, der er krævet for at kunne forstå øvelserne
Maksimum: 200
Maher Youssef Abou-Hachem , Lyngby Campus, Bygning 224, Tlf. (+45) 4525 2732 , maha@bio.dtu.dk
Jane Wittrup Agger , Lyngby Campus, Bygning 224, Tlf. (+45) 4525 2861 , jaag@dtu.dk
Jonas Nyvold Pedersen , Lyngby Campus, Bygning 345B, Tlf. (+45) 4525 6309 , jnpe@dtu.dk
27 Institut for Bioteknologi og Biomedicin
22 Institut for Sundhedsteknologi
I studieplanlæggeren
Overordnede kursusmål
At opnå eksperimentelle færdigheder indenfor vigtig biokemisk laboratorieteknik. At opnå kendskab til basale statistiske værktøjer, og anvende disse til at processere og kvantitativt evaluere biokemiske data genereret gennem kurset. Kursets indhold eksemplificerer og understøtter en del af den teoretiske undervisning, der gives i 27022 Biokemi.
Læringsmål
En studerende, der fuldt ud har opfyldt kursets mål, vil kunne:
  • Gennemføre basalt biokemisk relateret laboratoriearbejde på sikkerhedsmæssigt betryggende måde og bruge det statistiske program R til at analysere biokemiske eksperimentelle data
  • Anvende grundlæggende graftyper, herunder histogrammer og punktplot med standardafvigelser, for at repræsentere biokemiske data, samt identificere og beskrive sandsynlighedsfordelinger, herunder Poisson, binomial, eksponentiel og normal distribution og bruge dette til at evaluere egne datasæt
  • Anvende og fortolke vigtige statistiske begreber, såsom formulering af modeller, parameter estimering samt hypotese test og anvende statistiske metoder inden for simpel lineær regression
  • Demonstrere kendskab til opbygningen og egenskaberne af stofgrupperne proteiner og kulhydrater, som nøglemolekyler i biokemien.
  • Demonstrere basalt kendskab til enzymkemi og enzymkinetik.
  • Diskutere eksperimentelle resultater og sætte dem i relation til basal teori inden for biokemiens hovedområder.
  • Foretage et begrundet valg blandt de afprøvede analysemetoder til løsning af en given problemstilling.
  • Foretage oprensning af og beregne grad af udbytte af enzymer.
  • Foretage beregninger af tilsyneladende molekylvægt af proteiner, baseret på resultater fra SDS-PAGE analyse.
  • Foretage grundlæggende beregninger af enzymkinetiske parametre samt inhiberingskonstanter i forbindelse med enzymkinetiske undersøgelser.
  • Være i stand til at bruge enzymer til at syntetisere oligosakkarider og foretage produktseparation vha tyndlagskromatografi.
  • Formidle og statistisk evaluere biokemiske data i rapportform
Kursusindhold
Biokemiske, kromatiske og elektroforetiske metoder til at studere kulhydrater og proteiner. Rensning af proteiner og karakterisering af deres fysiske og kemiske egenskaber. Introduktion til grundlæggende enzym-assays for nedbrydning eller syntese af sukker og enzymkinetik. Introduktion til statistiske analyser, der vil blive integreret med forsøgsarbejdet for at evaluere autentiske data genereret af deltagerne i løbet af kurset
Litteraturhenvisninger
1. Øvelsesvejledninger udleveret af de kursusansvarlige

2. Biokemi-lærebog: R.L. Miesfeld, M.M. McEvoy: Biochemistry, 2017, ISBN: 978-0-393-61402-2

3. Statistik-lærebog: John R. Taylor: An Introduction to Error Analysis: The Study of Uncertainties in Physical Measurements 2. udgave, ISBN-13: 978-0-935-70242-2 (paperback anbefales)
Bemærkninger
Kurset udbydes til bachelorstuderende på Bioteknologiuddannelsen, Teknisk Biomedicin, Kvantitativ Biologi og Sygdomsmodellering, General Engineering samt Life Science & Tekonologi. Kurset kan med fordel tages samtidigt med 27022 Biokemi.

Deltagerne skal selv medbringe kittel og sikkerhedsbriller!
Sidst opdateret
28. november, 2022