26432 Avanceret Biomolekylær Kemi

2022/2023

Kurset afholdes for sidste gang E22. Kontakt din studieleder eller den kursusansvarlige for information om alternative kurser.
Kursusinformation
Advanced Biomolecular Chemistry
Engelsk
5
Kandidat
Kurset udbydes som enkeltfag
E5A (ons 8-12)
Campus Lyngby
Forelæsninger og opgaveregning.
13-uger
E5A, F5A, Mundtlig reeksamen om sommeren.
Mundtlig eksamen
Den mundtlige eksamen er baseret på et forskningspapir. Studerende får 8 forskningspapir den sidste dag af kursus. Ved eksamen vil han / hun få 5 spørgsmål til et forskningspapir og 2 yderligere spørgsmål. 20 min forberedelse og 20 min svar.
40 minutter.
Alle hjælpemidler er tilladt
7-trins skala , ekstern censur
26422 , Biomolekylær kemi
26411.27002/27020 , Organisk kemi 2. Biovidenskab.
Minimum 10 Maksimum: 50
Kira Astakhova , kiraas@kemi.dtu.dk
26 Institut for Kemi
I studieplanlæggeren
Kontakt underviseren for information om hvorvidt dette kursus giver den studerende mulighed for at lave eller forberede et projekt som kan deltage i DTUs studenterkonference om bæredygtighed, klimateknologi og miljø (GRØN DYST). Se mere på http://www.groendyst.dtu.dk
Overordnede kursusmål
Det formål med kurset er at give viden om den avancerede biomolekylære kemi og anvendelser i moderne nanobioteknologi og biovidenskab, især for design, syntese og anvendelser af modificerede peptider, kulhydrater, proteiner og nukleinsyrer. Kurset er meget forskningsorienteret, og der vil primært fokuseres på den nyeste forskning inden for biomolekylær kemi og nanobioteknologi.
Læringsmål
En studerende, der fuldt ud har opfyldt kursets mål, vil kunne:
  • Bestem de kemiske syntesetrin og planlægge karakteriseringsstrategier for glykaner
  • Design syntese af komplekse forgrenede oligosakkarider
  • Anvend strategier for kemisk og biomolekylær katalyse i planlægningssyntese af biomolekylære analoger
  • Udvælge passende beskyttelsesgrupper til monosakkarider og aminosyrer i relation til anvendelse i multi-trin syntese
  • Genkende modificerede nukleinsyreanaloger (herunder MO, PNA og LNA); diskutere deres struktur og egenskaber
  • Planlæg syntese, oprensning og analyse af modificerede nukleinsyrer ved anvendelse af f.eks. klikkemi, automatisk fastfase-oligonukleotidsyntese, kromatografi (søjle og HPLC), NMR og masse spektrometri (ESI og MALDI MS) teknikker
  • Planlæg syntesen af forskellige peptidanaloger og foreslå strategier for deres oprensning og karakterisering
  • Anvend teoretisk viden i enzymkinetik ved vurdering af udførelsen af syntetiske substrater
  • Sammenlign og kontraster de forskellige typer af inhibitorer med eksempler, herunder: overgangsstatsinhibitorer, selvmordsinhibitorer, irreversible inhibitorer, kompetitive og ikke-kompetitive inhibitorer
Kursusindhold
Introduktion og forfriskende nøglebegreber; biomolekylære lægemidler og biologiske barrierer. Nukleosidantibiotika: syntese og egenskaber. Genterapi; transfektionsreagenser og nanomaterialer. Avanceret oligonukleotidsyntese og genomics. DNA og RNA nanoteknologi. Glycomics del 1 - syntese af komplicerede oligosakkarider. Glycomics del 2 - kemisk og biologisk katalyse i moderne kulhydrat syntese. Syntese og oprensning af vanskelige peptidsekvenser; peptidbiokonjugering. Post-translationelle modifikationer af peptider og proteiner. Proteinligand og protein-protein-interaktioner; screeningsmetoder
Enzyminhibitorer og agonister: syntese, målgenkendelsesprincipper og nye applikationer
Proteinligand og protein-protein-interaktioner; screeningsmetoder. Nukleinsyre-proteininteraktioner og analyser for at studere det.
Litteraturhenvisninger
ADT Bio web book (fri adgang)

Post‐Translational Modifications in the Context of Therapeutic Proteins: An Introductory Overview, Prof. Dr. Gary Walsh. Wiley, 2009 (fri adgang)

Desuden diverse noter.
Sidst opdateret
05. juli, 2022