Overordnede kursusmål
Det formål med kurset er at give viden om den avancerede
biomolekylære kemi og anvendelser i moderne nanobioteknologi og
biovidenskab, især for design, syntese og anvendelser af
modificerede peptider, kulhydrater, proteiner og nukleinsyrer.
Kurset er meget forskningsorienteret, og der vil primært fokuseres
på den nyeste forskning inden for biomolekylær kemi og
nanobioteknologi.
Læringsmål
En studerende, der fuldt ud har opfyldt kursets mål, vil kunne:
- Bestem de kemiske syntesetrin og planlægge
karakteriseringsstrategier for glykaner
- Design syntese af komplekse forgrenede oligosakkarider
- Anvend strategier for kemisk og biomolekylær katalyse i
planlægningssyntese af biomolekylære analoger
- Udvælge passende beskyttelsesgrupper til monosakkarider og
aminosyrer i relation til anvendelse i multi-trin syntese
- Genkende modificerede nukleinsyreanaloger (herunder MO, PNA og
LNA); diskutere deres struktur og egenskaber
- Planlæg syntese, oprensning og analyse af modificerede
nukleinsyrer ved anvendelse af f.eks. klikkemi, automatisk
fastfase-oligonukleotidsyntese, kromatografi (søjle og HPLC), NMR
og masse spektrometri (ESI og MALDI MS) teknikker
- Planlæg syntesen af forskellige peptidanaloger og foreslå
strategier for deres oprensning og karakterisering
- Anvend teoretisk viden i enzymkinetik ved vurdering af
udførelsen af syntetiske substrater
- Sammenlign og kontraster de forskellige typer af inhibitorer
med eksempler, herunder: overgangsstatsinhibitorer,
selvmordsinhibitorer, irreversible inhibitorer, kompetitive og
ikke-kompetitive inhibitorer
Kursusindhold
Introduktion og forfriskende nøglebegreber; biomolekylære
lægemidler og biologiske barrierer. Nukleosidantibiotika: syntese
og egenskaber. Genterapi; transfektionsreagenser og nanomaterialer.
Avanceret oligonukleotidsyntese og genomics. DNA og RNA
nanoteknologi. Glycomics del 1 - syntese af komplicerede
oligosakkarider. Glycomics del 2 - kemisk og biologisk katalyse i
moderne kulhydrat syntese. Syntese og oprensning af vanskelige
peptidsekvenser; peptidbiokonjugering. Post-translationelle
modifikationer af peptider og proteiner. Proteinligand og
protein-protein-interaktioner; screeningsmetoder
Enzyminhibitorer og agonister: syntese, målgenkendelsesprincipper
og nye applikationer
Proteinligand og protein-protein-interaktioner; screeningsmetoder.
Nukleinsyre-proteininteraktioner og analyser for at studere det.
Litteraturhenvisninger
ADT Bio web book (fri adgang)
Post‐Translational Modifications in the Context of Therapeutic
Proteins: An Introductory Overview, Prof. Dr. Gary Walsh. Wiley,
2009 (fri adgang)
Desuden diverse noter.
Sidst opdateret
05. juli, 2022