Overordnede kursusmål
At udvikle et kendskab til grundlæggende metoder og begreber inden
for beregning af molekylers struktur, interaktion og dynamik. At
introducere anvendelse af computerbaserede beregningsmetoder i kemi
og biologi herunder lægemiddeldesign. Opnå erfaring med relevant
computer software.
Læringsmål
En studerende, der fuldt ud har opfyldt kursets mål, vil kunne:
- Visualisere molekylstrukturer på basis af krystallografiske
databaser
- Beskrive fundamentale metoder til beregning af molekylers
struktur og dynamik
- Anvende disse metoder til forudsigelse af molekylers
konformation
- Anvende disse metoder til at beregne vekselvirkning mellem
molekyler
- Beskrive reaktionsmekanismer i organisk kemi på kvantitativt
grundlag
- Beskrive ”guest-host” vekselvirkning mellem biomolekyler på
kvantitativt grundlag
- Anvende relevant computer software
- Demonstrere kendskab til computerbaseret lægemiddeldesign og
dets rolle i moderne lægemiddeludvikling
Kursusindhold
Introduktion til molekylmodellering og visualisering. Grundlæggende
metoder til beregning af molekylers struktur og dynamik:
Kvantekemi, molekylmekanik og molekylærdynamik. Eksempler på
anvendelser: Konformationssøgning, reaktionsmekanismer i organisk
kemi, enzym-substrat vekselvirkning, spektroskopi,
diffusionskonstanter, radiale fordelingsfunktioner. En række
computerøvelser illustrerer anvendelser inden for organisk kemi,
biokemi, og medicinalkemi herunder design af lægemidler.
Litteraturhenvisninger
Noter udleveres
Bemærkninger
Kurset kan benyttes som en introduktion til "computational
chemistry" for bachelorstuderende. Dette kursus illustrerer
flere begreber diskuteret i kurserne Kvantekemi (26261) og Fysisk
Kemi 3 (26231).
BSc studerende fra Kemi og Teknologi har fortrinsret i tilfælde af
lodtrækning. Ingen ordinær eksamen.
Sidst opdateret
22. december, 2022
