22603 Lysmikroskopi for life science

2021/2022

Et spændende, hands-on-orienteret kursus for fysikere og biologer, der kunne tænke sig teoretisk og praktisk lysmikroskopi-erfaring på CVet. Kurset kan tælle som Teknologisk specialisering på kandidatuddannelserne Fysik og Nanoteknologi og Bioteknologi, hvis der gives dispensation af studielederne.
Kursusinformation
Light microscopy for life science
Engelsk
5
Kandidat
E3A (tirs 8-12)
Campus Lyngby
Forelæsning og øvelser.

Øvelserne inkluderer praktiske øvelser (op til 30% af undervisningstiden), billedanalyse og journal club-lignende øvelser.

Praktiske øvelser indeholder:
- to roterende øvelser om basale metoder.
- en billedeanalyseøvelse.
- et miniprojekt udført på forskningsudstyr i mindre grupper inkl. prøveforberedelse, mikroskopering, billedeanalyse, fortolkning af for eksempel billedeartefakter.
13-uger
E3A
Mundtlig eksamen og bedømmelse af rapport(er)
Individuel, mundtlig eksamen og rapporter skrevet i grupper. Helhedsvurdering: den endelige karakter gives på baggrund af laboratoriejournaler, projekt-rapport og mundtlig eksamen.
30 minutter mundtlig eksam.
Alle hjælpemidler er tilladt
7-trins skala , ekstern censur
Liste over emner der overlapper med andre kurser: • Optics basics, bright field, dark field fluorescence (Kursus 22602) • Multiphoton microscopy (Kursus 22511) • Scattering and Absorption (Kursus 22511)
Minimum 10 Maksimum: 40
Rodolphe Charly Willy Marie , Lyngby Campus, Bygning 345B, Tlf. (+45) 4525 5676 , rcwm@dtu.dk
Dominik Marti , domar@dtu.dk
Kim Mortensen
Lars René Lindvold , Lyngby Campus, Bygning 345B, Tlf. (+45) 4677 4969 , lali@dtu.dk
Serhii Kostrikov , Lyngby Campus, Bygning 423, Tlf. (+45) 4525 8132 , serkos@dtu.dk
22 Institut for Sundhedsteknologi
I studieplanlæggeren
Kontakt underviseren for information om hvorvidt dette kursus giver den studerende mulighed for at lave eller forberede et projekt som kan deltage i DTUs studenterkonference om bæredygtighed, klimateknologi og miljø (GRØN DYST). Se mere på http://www.groendyst.dtu.dk
Overordnede kursusmål
Målet med kurset er at uddanne DTU's studerende (både MSc og PhD studerende) med forskellige baggrunde i teoretiske og praktiske færdigheder indenfor lys-mikroskopi, så de kan bruge lys-mikroskopi i life-science-anvendelser, som kræves af industrien og mange grene indenfor forskning.
Læringsmål
En studerende, der fuldt ud har opfyldt kursets mål, vil kunne:
  • Beskrive de basale optiske fænomener, så som interferens, diffraktion, konjugerede planer, aperturestops og bestemme forstørrelse, opløsning, billedfelt, belysningsprincipper og valg af detektor.
  • Beskrive kontrastmekanismer så som bright-field, dark-field, fase-kontrast og fluorescens.
  • Forklare basale mikroskopers funktioner så som bright-field-, dark-field-, fluorescens- og konfokalmikroskoper.
  • Forklare virkemåden af avancerede ikke-lineære teknikker, så som multi-foton-exciteret fluorescensmikroskopi.
  • Forklare virkemåden af tre typer superopløsningsmikroskopi med udgangspunkt i begrænsningerne for konventionel mikroskopi.
  • Evaluere og sammenligne teknikker så som bright-field/dark-field mikroskopi, fluorescensmikroskopi, konfokalmikroskopi og ikke-lineærmikroskopi (multi-foton).
  • Analysere videnskabelige artikler i kursets emneområde; evaluere den valgte mikroskopiteknik og foreslå alternativer.
  • Illustrere et passende valg af mikroskopiteknikker med udgangspunkt i analyser af opløsning, billedfelt, valg af detektor og signal-til-støj-argumenter.
  • Vælge og begrunde valget af en mikroskopiteknik til anvendelse på et givent life-scienceproblem.
  • Vælge og anvende analysemetoder til mikroskopibilleder så som segmentering, featuredetektion, punktsprednings-funktionsanalyse, punktlyskilde-lokalisering, og partikelsporing.
  • Designe et mikroskopiforsøg med et valg af kontrastmekanisme, instrument, lyskilde, optiske filtre, prøvefarvning og detektor.
Kursusindhold
Et stærkt fokus på fluorescens-mikroskopi-teknikker som kan anvendes indenfor life sciences.
Bemærkninger
Kurset er egnet til PhD studerende.
Sidst opdateret
16. september, 2021