At give studerende en omfattende teoretisk viden og praktisk erfaring med moderne syntetisk biologi, beregningsbiologi og stofskifte design til udvikling af industrielle cellefabrikker. En studerende, der fuldt ud har opfyldt kursets mål, vil kunne:

• Udvælge en passende cellefabrik, kulstofkilde, samt fermenteringsproces for at fremstille et bioprodukt, baseret på en teknisk-økonomisk analyse.
• Designe en biosyntetisk rute ved at bruge bioinformatiks værktøj og databaser.
• Designe strategier for et stammeoptimeringsprogram.
• Designe genetiske modificeringer af fem populær cellefabrikker (E. coli, S. cerevisiae, P. putida, Streptomyces, CHO) in silico ved at anvende en moderne syntetisk biologi-værktøjskasse (CRISPR-Cas9, USER, Gibson, in vivo recombination, RNA interference, osv.)
• Anvende syntetisk biologi værktøj for at gennemføre genetisk modificering af en cellefabrik i laboratoriet.
• Følge God laboratoriepraksis (GLP): registrere data i Laboratory Information Management System (LIMS) og føre en elektronisk laboratoriebog.
• Analysere og fortolke eksperimentelle resultater.
• Præsentere det udførte eksperimentelle studie.

De studerende vil lære at anvende “state-of-the-art” syntetisk biologi for at designe cellefabrikker til produktion af bio-baserede kemikalier og farmaceutiske ingredienser. Kurset består af forelæsninger og computer øvelser om formiddagen og projektarbejde i laboratoriet om eftermiddagen. De studerende vil vælge at følge et af de fem eksperimentelle spor, hvor de vil udføre et mindre forskningsprojekt med genetisk modificering af: (1) E. coli, (2) S. cerevisiae, (3) Streptomyces, (4) Pseudomonas putida eller (5) CHO. 26. februar, 2021