26245 Computerbaserede metoder i kemi og biologi

2020/2021

Kursusinformation
Applied computational chemistry
Engelsk
5
Bachelor
Kandidat
Juni
Campus Lyngby
3 uger. Forelæsninger og computerøvelser
3-uger
Bedømmelse af øvelser og rapport(er)
Beståelse af kurset er betinget af aktiv deltagelse i samtlige øvelser, derfor kræves der mødetid ved lektionens start og lægeattest ved fravær, hvis underviser forlanger det.
Alle hjælpemidler er tilladt
bestået/ikke bestået , intern bedømmelse
26201/26202/262712640026411/27002/26471 , eller tilsvarende indledende fysisk og organisk kemi.
Maksimum: 30
Niels Engholm Henriksen , Lyngby Campus, Bygning 206, Tlf. (+45) 4525 2029 , neh@kemi.dtu.dk
Günther H.J. Peters , Bygning 206, Tlf. (+45) 4525 2486 , ghp@kemi.dtu.dk
26 Institut for Kemi
I studieplanlæggeren
Overordnede kursusmål
At udvikle et kendskab til grundlæggende metoder og begreber inden for beregning af molekylers struktur, interaktion og dynamik. At introducere anvendelse af computerbaserede beregningsmetoder i kemi og biologi herunder lægemiddeldesign. Opnå erfaring med relevant computer software.
Læringsmål
En studerende, der fuldt ud har opfyldt kursets mål, vil kunne:
  • Visualisere molekylstrukturer på basis af krystallografiske databaser
  • Beskrive fundamentale metoder til beregning af molekylers struktur og dynamik
  • Anvende disse metoder til forudsigelse af molekylers konformation
  • Anvende disse metoder til at beregne vekselvirkning mellem molekyler
  • Beskrive reaktionsmekanismer i organisk kemi på kvantitativt grundlag
  • Beskrive ”guest-host” vekselvirkning mellem biomolekyler på kvantitativt grundlag
  • Anvende relevant computer software
  • Demonstrere kendskab til computerbaseret lægemiddeldesign og dets rolle i moderne lægemiddeludvikling
Kursusindhold
Introduktion til molekylmodellering og visualisering. Grundlæggende metoder til beregning af molekylers struktur og dynamik: Kvantekemi, molekylmekanik og molekylærdynamik. Eksempler på anvendelser: Konformationssøgning, reaktionsmekanismer i organisk kemi, enzym-substrat vekselvirkning, spektroskopi, diffusionskonstanter, radiale fordelingsfunktioner. En række computerøvelser illustrerer anvendelser inden for organisk kemi, biokemi, og medicinalkemi herunder design af lægemidler.
Litteraturhenvisninger
Noter udleveres
Bemærkninger
Kurset kan benyttes som en introduktion til "computational chemistry" for bachelorstuderende.

Ingen ordinær eksamen
Sidst opdateret
05. maj, 2020