Overordnede kursusmål
At give den studerende ekstensiv praktisk erfaring i
molekylærbiologisk, genetisk og fysiologisk håndtering af eukaryote
organismer.
Læringsmål
En studerende, der fuldt ud har opfyldt kursets mål, vil kunne:
- Udføre klassiske molekylærbiologiske/genetiske
eksperimenter.
- Beskrive DNA vedligeholdelse og kromosomsegregering i eukaryote
celler. Dette inkluderer fundementale molekylære genetiske
termer.
- Håndtere gær og skimmelsvampe.
- Planlægge, koordinere og udføre flere eksperimenter på samme
tid.
- Konstruere nye stammer ved 'gene targeting' og/eller
CRISPR/Cas9 gen editering.
- Ændre et eukaryotisk genom ved at introducere punktmutationer,
deletioner, 'GFP tags' eller andre modifikationer.
- Udføre beregninger baseret på resultater fra udførte
eksperimenter.
- Analysere og fortolke eksperimentelle resultater fra de
forskellige eksperimenter udført på kurset.
- Præsentere og forklare eksperimentelle resultater opnået på
kurset foran en forsamling.
Kursusindhold
Dette laboratoriekursus fokuserer på molekylærbiologi, genetik og
fysiology af gær og skimmelsvampe. Det består af to dele. Første
del består af en fast øvelsesdel, hvor de studerende lærer om DNA
dynamic. Hvor ofte muterer det, hvor ofte sker homolog
rekombination, hvor ofter mister celler et plasmid eller et
kromosom?
Vi vil undersøge hvordan defekter i DNA skade reparationssystemer
influerer cellulær fitness og opførsel. Under denne del, vil vi
anvende klassiske gær genetiske teknikker. Den anden del består af
individuelle projekter, hvor de studerende bliver delt i hold af to
personer, og der vil de udføre projekter der aldrig har været
udført før. Fokus på disse projekter er stammekonstruktion med
bagegær Saccharomyces cerevisiae eller skimmel som Aspergillus
niger fulgt af stamme karakterisering til at vurdere udfaldet af
den genetiske ændring. DNA manipulationerne er typisk
punktmutationer og deletioner; eller præcise indsættelser af
'bio bricks' såsom promotorer, reportergener og
terminatorer. I denne anden del vil vi bruge 'state of the
art' genetisk værktøj såsom CRISPR/Cas9 'gene editing'.
Kurset vil afsluttes med holdpræsentationer foran hele holdet og
det evalueres som bestået/ikke-bestået.
Bemærkninger
Kurset anbefales først efter kurserne 27230 and 27430.
Sidst opdateret
02. juli, 2019
