Overordnede kursusmål
Kurset fokuserer på eksperimentelle teknikker inden for
bioteknologi-relevante områder af bakteriologi og molekylær
mikrobiologi. I kurset vil du arbejde med både nye teknologier i
molekylær økologi, syntetisk biologi samt metoder til at udnytte
eller kontrollere den bakterielle biodiversitet, der findes i
naturen.
I løbet af kurset vil du:
- Anvende avancerede værktøjer, modeller og metoder inden for
molekylær mikrobiologi og økologi.
- kritisk evaluere eksperimentelle resultater og hypoteser.
Samlet set har kurset til formål at give dig kompetencer, der giver
dig mulighed for at designe, udvikle, bruge eller forbedre
bakteriesystemer til bioteknologiske anvendelser inden for
biokontrol, bioproduktion og medicinske scenarier.
Læringsmål
En studerende, der fuldt ud har opfyldt kursets mål, vil kunne:
- Vælg en relevant strategi til dyrkning af specifikke bakterier
fra miljøprøver.
- Identificer mikroorganismer ved brug af molekylære biologiske
metoder.
- Design en screeningsproces fra f.eks. isolering af en bioaktiv
bakterie til identifikation af et aktivt molekyle.
- Analyser naturlige mikrobielle samfund ved hjælp af
sekvensbaserede molekylære metoder.
- Brug bioinformatiske værktøjer til at analysere 16S rRNA
sekvenser og andre gensekvenser
- Analyser aktivitet og organisering af bakterier i in vitro
mikrobielle samfund og biofilm
- Brug avancerede mikroskopi metoder, herunder konfokal
mikroskopi.
- Anvend syntese biologiske værktøjer til at analysere
genfunktioner og mikrobielle fænotyper og processer.
- Anvend evolutionære metoder til at analysere genfunktioner samt
optimering af fænotyper.
- Evaluer, vælg og anvend den mest passende teknik (er) til at
teste en hypotese
- Fremlæg en metode anvendt i kurset samt de opnåede
resultater.
Kursusindhold
Kurset er baseret på aktiv deltagelse i laboratorieøvelser. Dette
omfatter praktisk arbejde i laboratoriet, forberedelse før
undervisning, databehandling og fortolkning, præsentation af
resultater i plenum samt skrivning af rapport. Det omfatter også at
tilegne sig den teoretiske baggrund, der ligger til grund for de
anvendte metoder og værktøjer, ud fra undervisningsmaterialet og
fra den videnskabelige litteratur.
Litteraturhenvisninger
I, Microbiologist: A Discovery-Based Course in Microbial Ecology
and Molecular Evolution
Sidst opdateret
28. november, 2019
