27001 Introduktion til kvantitativ biologi

2019/2020

Kurset har rolle som Ingeniørarbejde og er forbeholdt studerende indskrevet på Kvantitativ Biologi og Sygdomsmodellering.
Kursusinformation
Introduction to quantitative biology
Dansk
10
Bachelor
E5 (ons 8-17)
Campus Lyngby
Forelæsninger, opgaver/projekter, hjemmearbejde
13-uger
E5A
Mundtlig eksamen og bedømmelse af rapport(er)
Eksamen vil indeholde en programmeringsopgave. Løbende godkendelse af mindst 4 af 5 obligatoriske opgaver er en forudsætning for deltagelse i eksamen. Karakteren gives på baggrund af en helhedsvurdering af den afsluttende rapport og mundtlig eksamen.
ca. 20 minutter fremlæggelse og diskussion af egen opgave
Alle hjælpemidler er tilladt
7-trins skala , intern bedømmelse
24002
Minimum 10
Mikael Lenz Strube , Lyngby Campus, Bygning 221 , milst@dtu.dk
Gregers Jungersen
27 Institut for Bioteknologi og Biomedicin
22 Institut for Sundhedsteknologi
I studieplanlæggeren
Dette kursus giver den studerende en mulighed for at lave eller forberede et projekt som kan deltage i DTUs studenterkonference om bæredygtighed, klimateknologi og miljø (GRØN DYST). Se mere på http://www.groendyst.dtu.dk
Overordnede kursusmål
Kursets overordnede mål er at introducere nye studerende til uddannelsens indhold og struktur, samt tydeliggøre den studerendes ansvar for egen læring.
De studerende gives en grundlæggende forståelse af hvorledes omverdenen kan ’matematificeres’ og hvordan dette kan hjælpe til at genere ny viden. De studerende erhverver konkrete værktøjer til at bygge matematiske modeller af biologiske systemer.
De studerende motiveres til at forholde sig analytiske og resultatsøgende, gennem udvikling og implementering af forskellige R programmer i relation til opsamlet og tilgængelig data.
Læringsmål
En studerende, der fuldt ud har opfyldt kursets mål, vil kunne:
  • Opsætte en simpel årsag-og-effekt model
  • Skrive et program i R til at løse et modellerings problem
  • Evaluere spredning af sygdom ved hjælp af simulering
  • Indhente og evaluere relevant litteratur om biologiske modeller for sygdom
  • Selvstændigt formulere en model på baggrund af tilgængelige data
  • Fortolke de biologiske konsekvenser af at ændre variable i en model
  • Præsentere og diskutere matematiske modeller
  • Arbejde selvstændigt og i teams og planlægge opgavefordeling, tidsplaner og afleveringer
  • Beskrive sygdomsbiologi ved hjælp af matematik
  • Redegøre for kemiske og biokemiske processer via matematik
Kursusindhold
Studieintroduktion: DTU’s IT systemer inkl. litteratursøgning, uddannelsens anbefalede kursusplan, udarbejdelse af personlige studieplaner.
Matematisk modellering, programmering i R, taltransformation, indledende statistik, differensligninger, teoretiske og praktisk modellering af biologiske processer.
Litteraturhenvisninger
A First Course in Mathematical Modeling International ed 5th Revised ed (2013) by Steven Horton, William P. Fox, Frank R. Giordano. Brooks/Cole Publisher.
A First Course in Statistical Programming with R. 2nd ed (2016) by Braun & Murdoch
Bemærkninger
Dette kursus er tilrettelagt for studerende på 1. semester. Den studerende skal medbringe en bærbar computer, hvorpå der kan installeres R.
Sidst opdateret
02. juli, 2019