At give de studerende et indledende overblik over de forskellige typer af naturstoffer og eksempler på proteiner som mikroorganismer og planter kan biosyntetisere. Et andet hovedformål er at give de studerende en basal forståelse op kromatografi og analytiske metoder med særligt fokus på detektion af allerede kendte stoffer ved hjælp af masse spektrometri. Kurset henvender sig til bio- og farmatek studerende, samt studerende med interesse for organisk kemi, En studerende, der fuldt ud har opfyldt kursets mål, vil kunne:

• At kunne kende forskel på primære og sekundære metabolitter
• At kunne genkende naturstoffer af polyketid typen
• At kunne genkende naturstoffer af alkaloid typen
• At kunne genkende naturstoffer af terpene typen
• At forstå de basale principper for prøveforberedelse af vigtige naturstoffer, som f.eks. fast fase ekstraktion.
• At kunne forklare de basale principper bag væske kromatografi herunder brug af forskellige relevante kolonne typer.
• At kunne forklare de basale principper bag diode array detektion (DAD) of masse spektrometri (f.eks. GTOF MS) koblet til kolonne kromatografi.
• Forstå betydningen af nøjagtig massebestemmelse.
• At kunne anvende standard kromatografisk/​spektroskopisk software til dataanalyse.
• At kunne sammenligne data fra mikrobielle ekstrakter med spektroskopisk information i databaser.
• At kunne forklare de basale principper bag kvantitativ analyse af naturstoffer (f.eks. mykotoksiner).
• At kunne forklare de basale principper bag massespektrometri (f.eks. MALDI TOF) baseret analyse af proteiner.

Industriel produktion af små organiske molekyler (herunder naturstoffer) og protein ved hjælp af mikrobielle cellefabrikker forventes at stige i de kommende år. Eksempler på dette er nye antibiotika, anti cancer stoffer, små antimikrobielle proteiner og fødevare ingredienser som farvestoffer, antistoffer og vitaminer. Andre stoffer er giftige for mennesker og skal derfor undgås og kontrolleres for i levnedsmidler. Dette kursus vil gennemgå de vigtigste typer af naturstoffer, samt metoder til at analysere dem især baseret på væskekromatografi koblet til UV og massespektrometri. Undervisning vil være baseret på forelæsninger, opgaveløsning og gruppearbejde. 04. juli, 2018