02946 Scientific computing for Røntgen-tomografi

2018/2019

Kurset udbydes januar i ulige år, dvs. januar 2019, januar 2021, etc.
Kursusinformation
Scientific Computing for X-Ray Computed Tomography
Engelsk
5
Ph.d., Fagligt fokuseret kursus
Kurset udbydes som enkeltfag
Januar
Kurset udbydes januar i ulige år, dvs. januar 2019, januar 2021, etc.
Campus Lyngby
Seminarer og små rapporter om computer-øvelser.
3-uger
Bedømmelse af opgave(r)/rapport(er)
Alle hjælpemidler er tilladt
bestået/ikke bestået , intern bedømmelse
Erfaring med Matlab-programmering(fx 02631/33) og numeriske beregninger (fx 02601).
Minimum 5
Per Christian Hansen , Lyngby Campus, Bygning 303B, Tlf. (+45) 4525 3097 , pcha@dtu.dk

01 Institut for Matematik og Computer Science
I studieplanlæggeren
Overordnede kursusmål
Røntgen-CT bruges rutinemæssigt i medicin, materialevidenskab og mange andre områder til at rekonstruere et objekts indre vha matematiske metoder og numeriske algoritmer.
Dette kursus fokuserer på formulering, implementering og brug af standard rekonstruktions-metoder til CT, såsom Filtered Back Projection, algebraiske iterative rekonstruktions-metoder, og regulariserings-metoder. Vi giver en grundig matematisk beskrivelse af CT-rekonstruktionsproblemet, de tilhørende matematiske formuleringer samt de underliggende beregningsalgoritmer - suppleret med Matlab-computerøvelser. Målet er at deltagerne opnår en basal forståelse af formulering, implementering og brug af basale CT-rekonstuktionsmetoder, og således kan bruge disse til data-analyse af egne CT-rproblemer.
Læringsmål
En studerende, der fuldt ud har opfyldt kursets mål, vil kunne:
  • Forklare fysikken bag en CT-scanner.
  • Formulere den tilsvarende matematisk model og Radon-transformationen.
  • Formulere den inverse Radon-transformation og Filtered Back Projection-algoritmen.
  • Diskretisere Radon-transformationen og herved opstille et lineært ligningssystem.
  • Bruge singulær værdi dekomposition (SVD) til at analysere rekonstruktionsproblemet.
  • Formulere og bruge algebraiske iterative metoder som inkluderer simple bibetingelser.
  • Formulere konvergens-opførslen for disse metoder.
  • Forstå de underliggende principper og implementering af blok-metoder til storskala-problemer.
  • Bruge softwarepakken ASTRA til storskala-problemer.
  • Formulere variationelle problemer baseret på bayesiansk modellering af støjen.
  • Formulere og bruge Tikhonov-regularisering og Total Variation-regularisering.
  • Bruge moderne numeriske metoder for konveks optimering til CT-rekonstruktion.
Kursusindhold
Introduktion til CT med anvendelser. CT-scanneren. Radon-transformationen og dens inverse, Filtered Back Projetion. Diskretisering af CT-problemet. Singular værdi dekomposition (SVD) og dens brug til analyse af CT-problemer. Stabilitet og behovet for filtrereing; trunkeret SVD.
Algebraiske iterative rekonstruktions-algoritmer - grundlæggende teori og konvergensegenskaber. Metodernes opførsel med støjfyldte data; semi-konvergens og stopkriterier. Blok.algebraiske metoder til storskala-CT-problemer; brug af GPU'er. Softwarepakke ASTRA og dens algebraiske rekonstruktionsmetoder.
Støj-modeller, a priori-viden og regularisering. Variationelle formuleringer og bayesiansk modellering. Eksempler: Total Variation og Tikhonov regulariering. Introduktion til konveks optimering og numeriske optimerings-metoder. Artifakt-reduktion og modelkalibrering.
Sidst opdateret
06. august, 2018