Overordnede kursusmål
At give deltagerne basisviden om små-molekyler og proteiners
opbygning og struktur samt validering af røntgenstrukturer. At give
kendskab til og praktisk erfaring i krystallisering og
røntgenstrukturbestemmelse.
At give indføring i grundlæggende strukturkemiske begreber samt
anvendelser af røntgen- og synkrotronstråling til identificering og
fastlæggelse af rumlig struktur af krystallinske forbindelser inden
for uorganisk, organisk og biologisk kemi. At sætte deltagerne i
stand til at fortolke og udnytte strukturkemiske resultater og
databaser.
Læringsmål
En studerende, der fuldt ud har opfyldt kursets mål, vil kunne:
- bedømme og kritisere kvaliteten af en publiceret
røntgenstruktur
- kritisk vurdere og sammenligne krystalstrukturer fra
litteraturen eller databaser
- orientere sig i den krystallografiske litteratur og
databaser
- redegøre for krystalopbygning i termer af symmetrier,
rumgrupper og enhedsceller
- redegøre for grundlæggende røntgenspredningsteori
- definere det reciprokke gitter og relatere det til det direkte
gitter
- montere en krystal på et diffraktometer og gennemføre en
dataindsamling
- løse og beskrive en krystalstruktur af et mindre molekyle
- forklare hvordan en proteinstruktur løses ved hjælp af
molekylær erstatning
- forklare hvordan en proteinstruktur løses ved hjælp af isomorf
erstatning eller anomal spredning
- opsætte et krystallisationsforsøg
Kursusindhold
Primær, sekundær, tertiær og kvarternær struktur af proteiner.
Fundamental symmetrilære, herunder symmetrioperationer,
krystalsystemer og rumgruppenotation. Eksperimentelt arbejde med
krystallisering og test af krystalkvalitet. Løsning af
krystalstrukturer ved forskellige passende metoder.
Strukturvalidering og læsning af strukturartikler. Teori for
røntgenspredning fra krystaller. Enkrystaldiffraktometri. Teori for
strukturbestemmelse. Anvendelse af strukturkemiske databaser.
Litteraturhenvisninger
Werner Massa: Crystal structure determination. Second edition.
Springer. ISBN 3-540-20644-2 (kan lånes)
David Blow: Outline of Crystallography for Biologists. Oxford
University Press. ISBN 0-19-851051-9
Bemærkninger
Mulighed for efterfølgende projekt som specialkursus
Sidst opdateret
04. maj, 2017
