Indefor det veterinære område anvendes mekanistisk simulering ofte til at efterprøve epidemiologiske hypoteser. For at kunne teste disse hypotheser er et basalt kendskab til metoder indenfor simulering nødvendig. Formålet med dette kursus er at introducere deltagerne til mekanistisk Monte Carlo simulering i R. Kursets første del (1. uge) kan tages som e-læring og giver en introduktion til basale kommandoer og fundamentale koncepter i R. Derefter følger introduktion til strukturering af simulerings programmer og ofte anvendte mekanistiske modeller indenfor epidemiologien. Kurset fokuserer på simulerings af sygdomsspredning hos produktionsdyr (grise, køer, får, fjerkræ). I kurset vil også indgå dataopsamplings- og præsentations-teknikker for simuleringsmodeller. En studerende, der fuldt ud har opfyldt kursets mål, vil kunne:

• forstå basale koncepter om R
• Forstå basale principper i epidemiologisk simulering
• Konstruere simple deterministiske simulerings modeller
• Konstruere simple stokastiske simulerings modeller
• Konstruere simple stokastiske og dynamiske simulerings modeller
• Modellere simple spredningsmekanismer mellem enheder (f.eks enkelte dyr eller gårde)
• Samle resultater fra simuleringer og præsentere dem struktureret og informativt
• Læse og forstå videnskabelige artikler omhandlende de anvendte teknikker

Undervisning i deterministisk, stokastisk og dynamisk modellering. Deltagerne vil få kendskab til fordele og ulemper ved disse metoder. I e-lærings modulet (1. uge) vil der blive gennemgået de basale koncepter i R, som er nødvendige for kursets gennemførsel, herunder funktioner og løkker i R. Kurset indeholder ikke løsning af differentiallignings modeller. Kursusmaterialet består af noter og artikler som vil blive omdelt på kurset. 23. april, 2018