Kursets hovedformål: I) At give de studerende en basal teoretisk viden indenfor mikrobiologi og betydningen af mikrobielle samfunds sammensætning i relation til sygdom og sundhed II) At lære de studerende at arbejde sikkert med mikroorganismer i laboratoriet III) At introducere de studerende til de mikrobiologiske og molekylærbiologiske metoder, som anvendes til bestemmelse og karakterisering af komplekse mikrobielle samfund. En studerende, der fuldt ud har opfyldt kursets mål, vil kunne:

• Arbejde sikkert med mikroorganismer i laboratoriet.
• Beskrive krav til vækst af den bakterielle celle samt bestemme vækst af en bakteriel population.
• Forklare opbygning og funktion af den bakterielle cellevæg og membran.
• Anvende klassiske mikrobiologiske og molekylærbiologiske teknikker inklusiv mikroskopi til karakterisering af mikrobielle samfund og identifikation af sygdomsfremkaldende bakterier.
• Beskrive virkningen af antimikrobielle stoffer og forklare udvikling af resistente bakterier herunder horisontal genoverførsel.
• Vurdere ekperimentelle resultater i forhold til de forventede.
• Forholde sig kritisk til egne og andres resultater samt kunne diskutere dem i plenum.
• Finde og anvende relevant videnskabelig litteratur til understøttelse af egne resultater.

Teori: Kurset giver indledningsvis en introduktion til basal mikrobiologi: Opbygningen af den bakterielle cellevæg og membran, krav til næringsstoffer og atmosfære og bakteriel populationsvækst. Desuden omhandler kurset bakterielle infektioner og virulens faktorer, hæmning af bakteriers vækst med antimikrobielle stoffer f.eks. antibiotika og udvikling af resistente bakterier ved f.eks. genoverførsel. Endelig omhandler kurset introduktion til identifikation af potentielt sygdomsfremkaldende bakterier fra en kompleks mikrobiel prøve, blandt andet under anvendelse af næste-generations sekventering (teori og databehandling)

Laboratorieøvelser: Klassiske mikrobiologiske teknikker som rendyrkning af bakterier, CFU-bestemmelse, OD-målinger og gramfarvning. Introduktion til molekylærbiologiske metoder som PCR, kvantitativ real-time PCR (qPCR), MALDI-TOF, Fluorescens in situ hybridisering (FISH) og mikroskopering. Kurset tilbydes kun studerende optaget på bachelorforløbet Teknisk Biomedicin.

Da vi skal i gang med at dyrke bakteriekulturer fra første dag, er det vigtigt, at deltagerne er med ALLE dage i 3-ugers perioden. Så før man melder sig til kurset, skal man være sikker på, at man overholde dette krav.

Til kursets teoretiske del anvendes bogen David Greenwood, Richard C. B. Slack, Michael R. Barer and W L Irving, Medical Microbiology (Eighteenth Edition): https:/​/​www.elsevier.com/​books/​medical-microbiology/​greenwood/​978-0-7020-4089-4 20. april, 2018