29902 Videregående Eksperimentel Syntetisk Biologi for Cellefabrikker

2016/2017

Kurset er arrangeret af Novo Nordisk Foundation Center for Biosustainability og vil finde sted på Centerets laboratorier i bygning 220.
Kursusinformation
Advanced Experimental Synthetic Biology for Cell Factories
Engelsk
4
Ph.d., Fagligt fokuseret kursus
Kurset udbydes under tompladsordningen
1.06.2017-16.06.2017 [begge dage inkl.] plus forberedelse
DTU Biosustain, bygn 220
Eksperimentelt arbejde, dataanalyse, gruppearbejde, forelæsninger og projektarbejde
[Kurset følger ikke DTUs normale skemastruktur]
Umiddelbart efter undervisningen (3-ugers-kursus)
Mundtlig eksamen
Præsentation af projekt
Alle hjælpemidler er tilladt
bestået/ikke bestået , intern bedømmelse
27027
27026/27611/27405 , 27026 - Teoretisk molekylær mikrobiologi 27611 - Introduktion til bioinformatik 27405 - Cellefabrikker: Design, konstruktion og analyse
Minimum 12 Maksimum: 25
Irina Borodina , Lyngby Campus, Bygning 220, Tlf. (+45) 4525 8020 , irbo@biosustain.dtu.dk
Michael Krogh Jensen , Lyngby Campus, Bygning 220 , mije@biosustain.dtu.dk

29 DTU Biosustain
I studieplanlæggeren
Dette kursus giver den studerende en mulighed for at lave eller forberede et projekt som kan deltage i DTUs studenterkonference om bæredygtighed, klimateknologi og miljø (GRØN DYST). Se mere på http://www.groendyst.dtu.dk
Overordnede kursusmål
At give studerende en omfattende teoretisk viden og praktisk erfaring med moderne syntetisk biologi, beregningsbiologi og stofskifte design til udvikling af industrielle cellefabrikker.
Læringsmål
En studerende, der fuldt ud har opfyldt kursets mål, vil kunne:
  • Udvælge en passende cellefabrik, kulstofkilde, samt fermenteringsproces for at fremstille et bioprodukt, baseret på en teknisk-økonomisk analyse.
  • Designe en biosyntetisk rute ved at bruge bioinformatiks værktøj og databaser.
  • Designe strategier for et stammeoptimeringsprogram.
  • Designe genetiske modificeringer af populære cellefabrikker (E. coli, S. cerevisiae, Streptomyces, Pseudomonas, and CHO) in silico ved at anvende en moderne syntetisk biologi-værktøjskasse (CRISPR-Cas9, USER, Gibson, in vivo recombination, RNA interference, osv.)
  • Anvende syntetisk biologi værktøj for at gennemføre genetisk modificering af en cellefabrik i laboratoriet.
  • Følge God laboratoriepraksis (GLP): registrere data i Laboratory Information Management System (LIMS) og føre en elektronisk laboratoriebog.
  • Analysere og fortolke eksperimentelle resultater.
  • Præsentere det udførte eksperimentelle studie.
Kursusindhold
De studerende vil lære at anvende “state-of-the-art” syntetisk biologi for at designe cellefabrikker til produktion af bio-baserede kemikalier og farmaceutiske ingredienser. Kurset består af forelæsninger og computer øvelser om formiddagen og projektarbejde i laboratoriet om eftermiddagen. De studerende vil vælge at følge et af de fire eksperimentelle spor, hvor de vil udføre et mindre forskningsprojekt med genetisk modificering af: (1) Pseudomonas, (2) S. cerevisiae, (3) Streptomyces, eller (4) CHO.
Sidst opdateret
22. maj, 2017