Det overordnede formål med dette kursus er at give de studerende et uddybende kendskab til: i) biosyntese af forskellige typer af komplekse små organiske molekyler (sekundære metabolitter = naturstoffer); ii) de forskellige typer af enzymer, som katalyserer biokemiske reaktioner, samt; iii) opbygningen af sekundære metabolit kodende genklustre, og iv) hvorledes man kan bruge bioinformatiske metoder til at koble viden om gener til kemiske strukturer og omvendt. En studerende, der fuldt ud har opfyldt kursets mål, vil kunne:

• Uddybende forståelse af biosyntese af polyketider.
• Uddybende forståelse af biosyntese af ribosomale og non-ribosomale peptider.
• Uddybende forståelse af biosyntese af terpener, og naturstoffer af blandet biosyntetisk oprindelse.
• Evne til udfra en given kemisk struktur at kunne forudsige opbygningen af det relaterede genkluster i både bakterier og svampe.
• Godt kendskab til brug af bioinformatiske metoder som AntiSMASH til analyse af sekundære metabolit klustre.
• Godt kendskab til brug af bioinformatiske metoder som BLAST, HMMer, Interproscan til at forudsige typer af enzym aktiviteter.
• Basal viden om analyse og håndtering af fuld genomdata fra mikroorganismer.
• Evne til at forudsige typer af naturstoffer og deres biosyntese baseret på analyse af genomdata.

Avanceret forståelse for biosyntese af komplekse naturstoffer som polyketider, non-ribosomale peptider, terpener og stoffer af blandet biosyntetisk oprindelse. Anvendelse af bioinformatisk baserede analyse metoder, som AntiSMASH til annotering af de gener (og klustre), der ligger til grund for de mange typer af enzymkatalyserede reaktioner, der er involveret i biosyntese af naturstoffer. Kurset henvender sig til både biotek og kemi studerende, der gerne vil udvide deres biokemiske kompetencer, og er interesseret i ”naturens organiske kemi”. 13. december, 2016