Peptider er de fragmenter som proteiner er opbygget af, og peptidsyntese ved brug af kemiske metoder er et vigtigt værktøj i fremstilling af farmaceutiske stoffer såsom medicin og vacciner, og/eller som kunstige epitoper til fremstilling af antistoffer mv. På kurset forsøger vi at fremstille vi nogle nye peptid-baserede stoffer som efter kursusperioden vil blive testet for deres biologiske aktivitet. Den studerende vil under syntese af stofferne stifte bekendtskab med flere forskellige fastfase syntesestrategier ved brug af forskellige kemiske håndtag, samt brug af de almindeligt anvendte beskyttelsesgrupper i peptid kemi. Teknikker til dannelse af glycopeptider samt brug af nativ kemisk ligering til dannelse af større peptider vil også blive afprøvet. En studerende, der fuldt ud har opfyldt kursets mål, vil kunne:

• Anvende forskellige syntesestrategier til dannelse af peptider samt peptid-derivater på fastfase
• Redegøre for fordele samt ulemper ved at syntetisere peptider ved fastfase syntese
• Redegøre for mekanismerne bag peptid koplingsreaktioner (kemoselektivitet og eventuelle bireaktioner) samt mekanismerne ved kløvning af beskyttelsesgrupper og linkere fra peptidet
• Fremstille peptider med C-terminale modifikationer
• Syntetisere forgrenede peptider (peptid dendrimerer)
• Udføre forskellige typer af oprensninger/​oparbejdning afhængig af peptidets struktur og opløselighed
• Udføre forskellige 'on-resin' analysemetoder (kolorimetriske tests og IR), samt analysere peptid produkterne med HPLC-MS
• Udføre C-terminal modificering af peptider i væskefase og sammenkoble peptidsegmenter via nativ kemisk ligering

På kurset forsøger vi at fremstille vi nogle nye peptid-baserede stoffer som efter kursusperioden vil blive testet for deres biologiske aktivitet. Den studerende vil under syntese af stofferne stifte bekendtskab med flere forskellige fastfase syntesestrategier ved brug af forskellige kemiske håndtag, sådsom 'backbone amide linker' (BAL) strategi der muliggør fremstilling af C-terminalt modificerede peptider, samt linkere til fremstilling af beskyttede peptider. Under arbejdet stifter den studerende bekendtskab med almindeligt anvendte beskyttelsesgrupper i peptid kemi. Endvidere vil vi anvende forskellige metoder til dannelse af glycopeptider samt undersøge nativ kemisk ligering til segment kobling af peptider for at danne større peptidstrukturer. De fremstillede stoffer vil blive analyseret ved HPLC, MS, HPLC-MS og IR Litteratur relevant for kurset vil blive givet sammen med øvelsesvejledning ved kursusstart Idet kursets øvelser er del af igangværende projekter på instituttet vil det være muligt for interesserede studerende at fortsætte temaer fra øvelserne i et kandidatspeciale eller specialkursus efter ønske 01. november, 2016