24007 Biokonjugat kemi

2016/2017

Kursusinformation
Bioconjugate Chemistry
Dansk
5
Bachelor
Kandidat
Juni
DTU-Veterinærinstituttet, Bülowsvej 27, 1870 Fredereiksberg C
Kurset vil bestå af praktiske øvelser samt instruktion/diskussion af teorien bag øvelserne
3-uger
Ingen eksamen
Bedømmelse af øvelser og rapport(er)
Alle hjælpemidler er tilladt
bestået/ikke bestået , intern bedømmelse
26407 og 26436
Maksimum: 8
Ulrik Boas , Lyngby Campus, Bygning 204, Tlf. (+45) 3588 6215 , UBOA@vet.dtu.dk
Peter Mikael Helweg Heegaard , Lyngby Campus, Bygning 204, Tlf. (+45) 3588 6241 , PMHH@vet.dtu.dk

24 Veterinærinstituttet
I studieplanlæggeren
15. maj
Kontakt underviseren for information om hvorvidt dette kursus giver den studerende mulighed for at lave eller forberede et projekt som kan deltage i DTUs studenterkonference om bæredygtighed, klimateknologi og miljø (GRØN DYST). Se mere på http://www.groendyst.dtu.dk
Overordnede kursusmål
Biokonjugater er kemisk modificerede biomolekyler, herunder peptider, proteiner, kulhydrater, nucleotider og lipider. Biokonjugater indgår som vigtige værktøjer i farma, nano-og bioteknologi f.eks. til fremstilling af semisyntetiske vaccinekomponenter, mærkning af proteiner (fluorescens, enzymer, haptener), udvikling af diagnostik og biosensorer mm. På kurset arbejder man med en række metoder til fremstilling og analyse af biokonjugater ved kemiske, biologiske og immunologiske metoder. Kurset giver den studerende teoretiske og praktiske værktøjer til fremstilling af peptider ved fast-fase kemi, dannelse af peptider ved segmentkopling, kemoselektiv syntese af glycokonjugater ved ligering samt teknikker til fluorescensmærkning af peptider og proteiner samt kulhydrater. Foruden de praktiske øvelser får den studerende et teoretisk indblik i de særlige krav der stilles til kemiske metoder der anvendes på biomolekyler, herunder krav om skånsomhed og selektivitet med henblik på opretholdelse af biomolekylets biologiske aktivitet.
Læringsmål
En studerende, der fuldt ud har opfyldt kursets mål, vil kunne:
  • Foreslå koblingsstrategier til konjugation af en række stoffer med forskellige kemiske funktionaliteter til biomolekyler som peptider, proteiner og kulhydrater
  • Fremstille peptider ved fast-fase syntese samt forklare de grundlæggende principper bag
  • Udføre mærkning af proteiner med små molekyler og analysere kvaliteten af denne mærkning
  • Foreslå og udføre konjugationsmetoder til stabilisering af antistoffers struktur og bioaktivitet
  • Redegøre for de kemiske principper ved biokonjugationsmetoder såsom kemo- og regioselektivitet og hvilke krav der stilles til metoderne for at bevare biomolekylets aktivitet
  • Vælge egnet analysemetode til analyse af biokonjugatets molekylære egenskaber såsom funktionelle grupper, masse, ladning, antigenicitet samt bioaktivitet
  • Udføre HPLC-MS, gel-elektroforese, bioanalyse vha ELISA assay samt fortolke analyse resultaterne og forklare principperne, herunder begrænsninger og anvendelsesområder for disse metoder
  • Redegøre for anvendelsen af mærkede og konjugerede biomolekyler i forskellige typer af assays
  • Redegøre for anvendelsen af konjugerede molekyler i biologisk/​farmateknologisk sammenhæng
Kursusindhold
På kurset arbejdes med en række metoder til fremstilling og analyse af biokonjugater ved kemiske, biologiske og immunologiske metoder. Kurset omfatter praktiske øvelser i fremstilling af peptider ved fast-fase kemi, med gennemgang af de mest anvendte beskyttelsesgrupper, dannelse af peptider ved segmentkopling (f.eks. nativ ligering) af mindre peptider, kemoselektiv beskyttelsesgruppefri syntese af glycokonjugater ved ligering samt teknikker til fluorescensmærkning af peptider og proteiner samt kulhydrater. Foruden de praktiske øvelser får den studerende et teoretisk indblik i de særlige krav der stilles til kemiske metoder der anvendes på biomolekyler, herunder krav om skånsomhed og selektivitet med henblik på opretholdelse af biomolekylets biologiske aktivitet. De fremstillede stoffer vil blive analyseret ved HPLC, MS, HPLC-MS og IR samt ved elektroforese og immunassays til bestemmelse af renhed, molekylær sammensætning og biologisk aktivitet.
Litteraturhenvisninger
Litteratur relevant for kurset vil blive givet sammen med øvelsesvejledning ved kursusstart
Sidst opdateret
01. november, 2016