24002 Introduktion til kvantitativ biologi

2016/2017

Kurset har rolle som Ingeniørarbejde og er forbeholdt studerende indskrevet på Kvantitativ Biologi og Sygdomsmodellering.
Kursusinformation
Introduction to Quantitative Biology
Dansk
10
Bachelor
E5 (ons 8-17)
I 2016 undervises på DTU Veterinærinstituttet, Bülowsvej 27, 1870 Frederiksberg. Fra 2017 undervises på DTU Campus Lyngby.
Forelæsninger, opgaver/projekter, laboratoriearbejde, hjemmearbejde
13-uger
Aftales med underviser, Eksamensdage d. 15-16/12 eller 21-22/12-2016
Mundtlig eksamen og bedømmelse af rapport(er)
Eksamen vil indeholde en programmeringsopgave. Godkendelse af obligatoriske opgaver er en forudsætning for deltagelse i eksamen.
ca. 20 minutter fremlæggelse og diskussion af egen opgave
Alle hjælpemidler er tilladt
7-trins skala , intern bedømmelse
Minimum 10 Maksimum: 35
Gregers Jungersen , Lyngby Campus, Bygning 204, Tlf. (+45) 3588 6234 , GRJU@vet.dtu.dk
Mikael Lenz Strube , Lyngby Campus, Bygning 204, Tlf. (+45) 3588 6873 , milst@vet.dtu.dk

24 Veterinærinstituttet
I studieplanlæggeren
Dette kursus giver den studerende en mulighed for at lave eller forberede et projekt som kan deltage i DTUs studenterkonference om bæredygtighed, klimateknologi og miljø (GRØN DYST). Se mere på http://www.groendyst.dtu.dk
Overordnede kursusmål
Kursets overordnede mål er at introducere nye studerende til uddannelsens indhold og struktur, samt tydeliggøre den studerendes ansvar for egen læring.
De studerende gives en grundlæggende forståelse af hvorledes omverdenen kan ’matematificeres’ og hvordan dette kan hjælpe til at genere ny viden. De studerende erhverver konkrete værktøjer til at bygge matematiske modeller af biologiske systemer.
De studerende motiveres til at forholde sig analytiske og resultatsøgende, gennem udvikling og implementering af forskellige R programmer i relation til opsamlet og tilgængelig data.
Læringsmål
En studerende, der fuldt ud har opfyldt kursets mål, vil kunne:
  • Opsætte en simpel årsag-og-effekt model
  • Skrive et program i R til at løse et modellerings problem
  • Evaluere spredning af sygdom ved hjælp af simulering
  • Indhente og evaluere relevant litteratur om biologiske modeller for sygdom
  • Selvstændigt formulere en model på baggrund af tilgængelige data
  • Fortolke de biologiske konsekvenser af at ændre variable i en model
  • Præsentere og diskutere matematiske modeller
  • Arbejde selvstændigt og i teams og planlægge opgavefordeling, tidsplaner og afleveringer
  • Beskrive sygdomsbiologi ved hjælp af matematik
Kursusindhold
Studieintroduktion: DTU’s IT systemer, uddannelsens anbefalede kursusplan, udarbejdelse af personlige studieplaner.
Matematisk modellering, programmering i R, sygdomsbiologi, taltransformation, indledende statistik, differens ligninger, teoretiske modeller, mikrobiologiske laboratorieøvelser.
Litteraturhenvisninger
A First Course in Mathematical Modeling International ed 5th Revised ed (2013) by Steven Horton, William P. Fox, Frank R. Giordano. Brooks/Cole Publisher.
Bemærkninger
Dette kursus er tilrettelagt for studerende på 1. semester. Den studerende skal medbringe en bærbar computer, hvorpå der kan installeres R.
Sidst opdateret
17. oktober, 2016