2015/2016

27750 Videregående Eksperimentel Syntetisk Biologi for Cellefabrikker

Kurset er arrangeret af Novo Nordisk Foundation Center for Biosustainability og vil finde sted på Centerets laboratorier i DTU-SCION park i Hørsholm.

Engelsk titel:

Advanced Experimental Synthetic Biology for Cell Factories

Sprog:

Point( ECTS )

5

Kursustype:

Kandidat
Ph.d.
Kurset udbydes under tompladsordningen
 

Skemaplacering:

Juni

Undervisningens placering:

DTU Biosustain, Kogle allé 6, 2970 Hørsholm

Undervisningsform:

Eksperimentelt arbejde, dataanalyse, gruppearbejde, forelæsninger og projektarbejde

Kursets varighed:

3-uger

Eksamensplacering:

Umiddelbart efter undervisningen (3-ugers-kursus)

Evalueringsform:

Hjælpemidler:

Bedømmelsesform:

Obligatoriske forudsætninger:

Anbefalede forudsætninger:

,

Deltagerbegrænsning:

Minimum 12 Maksimum: 25

Overordnede kursusmål:

At give studerende en omfattende teoretisk viden og praktisk erfaring med den moderne syntetisk biologi for at udvikle industrielle cellefabrikker.

Læringsmål:

En studerende, der fuldt ud har opfyldt kursets mål, vil kunne:
  • Udvælge en passende cellefabrik, kulstofkilde, samt fermenteringsproces for at fremstille et bioprodukt, baseret på en teknisk-økonomisk analyse.
  • Designe en biosyntetisk rute ved at bruge bioinformatiks værktøj og databaser.
  • Designe strategier for et stammeoptimeringsprogram.
  • Designe genetiske modificeringer af fire populær cellefabrikker (E. coli, S. cerevisiae, Streptomyces, CHO) in silico ved at anvende en moderne syntetisk biologi-værktøjskasse (CRISPR-Cas9, USER, Gibson, in vivo recombination, RNA interference, osv.)
  • Anvende syntetisk biologi værktøj for at gennemføre genetisk modificering af en cellefabrik i laboratoriet.
  • Følge God laboratoriepraksis (GLP): registrere data i Laboratory Information Management System (LIMS) og føre en elektronisk laboratoriebog.
  • Analysere og fortolke eksperimentelle resultater.
  • Præsentere det udførte eksperimentelle studie.

Kursusindhold:

De studerende vil lære at anvende “state-of-the-art” syntetisk biologi for at designe cellefabrikker til produktion af bio-baserede kemikalier og farmaceutiske ingredienser. Kurset består af forelæsninger og computer øvelser om formiddagen og projektarbejde i laboratoriet om eftermiddagen. De studerende vil vælge at følge et af de fire eksperimentelle spor, hvor de vil udføre et mindre forskningsprojekt med genetisk modificering af: (1) E. coli, (2) S. cerevisiae, (3) Streptomyces, eller (4) CHO.

Mulighed for GRØN DYST deltagelse:

Dette kursus giver den studerende en mulighed for at lave eller forberede et projekt som kan deltage i DTUs studenterkonference om bæredygtighed, klimateknologi og miljø (GRØN DYST). Se mere på http://www.groendyst.dtu.dk

Kursusansvarlig:

Irina Borodina , Hørsholm, Bygning Cederhuset, Tlf. (+45) 4525 8020 , irbo@biosustain.dtu.dk
Søren Molin , Bygning 301, Tlf. (+45) 4525 2513 , sm@bio.dtu.dk

Institut:

27 Institut for Systembiologi

Tilmelding:

I CampusNet
Sidst opdateret: 16. februar, 2016