Kurset er en blanding af forelæsninger og korte
laboratorieøvelser med efterfølgende dataanalyse. De studerende
deles i hold af ca. 3 som skal aflevere ca. 2 rapporter i løbet af
kurset.
De studerense skal opnå teoretiske og praktiske færdigheder inden
for massespektrometri og kromatografiske analyser af organiske og
speciel bioorganiske molekyler. Baseret på forskellige mål
molekyler, skal de studerende lære at sætte instrumenterne op til
de forskellige analyser, lave data analysen, foruden planlægge,
udføre og validere prøveforberedelsen.
Læringsmål:
En studerende, der fuldt ud har opfyldt kursets mål, vil kunne:
Forstå og udvælge den bedst mulige instrument til et givent
analytisk problem (ion-trap, Quadrupole, Orbitrap etc, og koblede
versioner af disse)
Lave peptid sekventering af protein og fortolke
resultaterne
Analysere højopløsnings MS data incl. addukt data til at finde
den rigtige elementar komposition
Kunne vælge den mest fordelagtige ioniserings teknik til en
given stofklasse og analytisk problemstilling
At kunne opsætte kvantitative LC-MS og LC-MS/MS incl.
korrektion for matrix interferens både med og uden intern
standard
Kunne udvælge passende solventer og bufre til analyse af
proteiner, peptider og små molekyler til både negative og positiv
ionisering, samt matrix til MALDI
Udvælge en passende prøveforberedelse incl. SPE (RP, NP, ion
bytning, mixed mode, ion-pair) som skal bruges til at gøre prøver
klar til for LC-MS og MALDI
Bruge LogD og pKa for en række analytter til at optimere væske
kromatografi
Kursusindhold:
Forskere der arbejder med drug-discovery og udvikling, biokemi,
cellefarbikker, synthetisk biologi, har brug for at identificere og
i mange tilfælde også kvantificere produkterne samt evt.
biprodukter.
Kurset fokuserer på MS teknikker kombineret med væskekromatografi
til identifikation af både små molekyler (antibiotika,
farmaceutika, sekundære metabolitter) samt proteiner (og peptides
efter nedbrydning af proteinerne).
Kurset vil bruge nogle eksempler med enzymreaktioner til
integration af både intakte proteiner og små molekyler.
Mulighed for GRØN DYST deltagelse:
Dette kursus giver den studerende en mulighed for at lave eller
forberede et projekt som kan deltage i DTUs studenterkonference om
bæredygtighed, klimateknologi og miljø (GRØN DYST). Se mere på
http://www.groendyst.dtu.dk
