At udvikle et kendskab til grundlæggende metoder og begreber inden
for beregning af molekylers struktur, interaktion og dynamik. At
introducere anvendelse af computerbaserede beregningsmetoder i kemi
og biologi herunder lægemiddeldesign. Opnå erfaring med relevant
computer software.
Læringsmål:
En studerende, der fuldt ud har opfyldt kursets mål, vil kunne:
Visualisere molekylstrukturer på basis af krystallografiske
databaser
Beskrive fundamentale metoder til beregning af molekylers
struktur og dynamik
Anvende disse metoder til forudsigelse af molekylers
konformation
Anvende disse metoder til at beregne vekselvirkning mellem
molekyler
Beskrive reaktionsmekanismer i organisk kemi på kvantitativt
grundlag
Beskrive ”guest-host” vekselvirkning mellem biomolekyler på
kvantitativt grundlag
Anvende relevant computer software
Demonstrere kendskab til computerbaseret lægemiddeldesign og
dets rolle i moderne lægemiddeludvikling
Kursusindhold:
Introduktion til molekylmodellering og visualisering. Grundlæggende
metoder til beregning af molekylers struktur og dynamik:
Kvantekemi, molekylmekanik og molekylærdynamik. Eksempler på
anvendelser: Konformationssøgning, reaktionsmekanismer i organisk
kemi, enzym-substrat vekselvirkning. En række computerøvelser
illustrerer anvendelser inden for organisk kemi, biokemi, og
medicinalkemi herunder design af lægemidler.
Litteraturhenvisninger:
Noter udleveres
Bemærkninger:
Kurset kan også benyttes som en introduktion til
"computational chemistry" for bachelorstuderende.
