Juni
Den første uge af kurset vil foregår i Silkeborg. Udgifter til
transport og ophold for studerende indskrevet på
kandidatuddannelsen i Akvatisk Videnskab og Teknologi afholdes af
DTU Aqua
Det overordnede formål med dette kursus er at give de studerende
viden om, hvorledes vilde fisk er opdelt i genetisk adskilte
populationer. Gennem forelæsninger, prkatisk laboratoriearbejde og
seminarer skal de studerende kunne forstå og analysere, hvorledes
den genetiske sammensætning og evolution er betydende for
populationernes overlevelse og produktivitet, og hvorledes
menneskeskabte påvirkninger, såsom klimaændringer og fiskeri kan
føre til evolutionære ændringer i bestandene. De studerende vil
lære, hvorledes genetiske date genereres i praksis i laboratoriet,
kan bruges til at analysere, hvorledes fisk er opdelt i
populationer og anvendes som praktisk værktøj i
fiskeriforvaltningen. Endelig forventes de studerende at være i
stand til at analysere, hvilke konsekvenser forskellige
forvaltningstiltag kan have for den genetiske diversitet og
overlevelsen af vilde fiskepopulationer.
Læringsmål:
En studerende, der fuldt ud har opfyldt kursets mål, vil kunne:
Forstå fundamentale populationsgenetiske sammenhænge. Dette
inkluderer forståelse af centrale begreber såsom selve
populationsbegrebet, genflow, effektiv populationsstørrelse,
selektion og lokal tilpasning.
Gennemføre praktisk DNA arbejde i laboratoriet, inklusiv DNA
ekstraktion, PCR analyse og genotypning af morderne DNA
markører.
Forstå centrale begreber og anbefalinger i conservationbiologi,
såsom anbefalinger for effektiv populationsstørrelse for at undgå
indavl og tab af vigtige egenskaber og design af beskyttede
habitater.
Opnå viden om genetiske markører og forståelse for deres
anvendelighed i populationsgenetiske analyser og i praktisk
fiskeriforvaltning, inklusiv bestandsvurdering og
fiskerikontrol
Analysere populationsgenetiske data med statistiske metoder af
relevans for fiskeriforskning og –forvaltning så som klassiske
analyser til genetisk identifikation af adskilte populationer,
estimering af effektiv populationsstørrelse og genflow, assignment
tests og mixed-stock analyse til anvendelse i bestandsvurdering og
fiskerikontrol .
Opnå viden om den nyeste udvikling indenfor genom-forskningen,
og hvorledes disse metoder kan anvendes indenfor fiskeriforskning
og –forvaltning. Dette inkluderer metoder til storskala screening
af økologisk vigtige gener med henblik på at opnå viden om lokale
tilpasninger til det fysiske, kemiske og biologiske miljø, samt
analyse af gen-ekspression til vurdering af miljøinduceret
stress.
Analysere og vurdere hvilke konsekvenser, ødelæggelse af
habitater samt fiskeri-induceret selektion og klimaændringer kan
have på fiskepopulationers genetiske sammensætning og fremtidige
evolution, samt de resulterende konsekvenser for populationernes
demografi.
Analysere og vurdere, hvilke genetiske, evolutionære og
resulterende demografiske konsekvenser forskellige
forvaltningstiltag kan have for vilde fiskepopulationer, såsom
regulering af fiskeriet gennem mindstemål og fangstrestriktioner,
etablering af marine reservater samt udsætninger af opdrættede
fisk.
Kursusindhold:
Kurset er baseret på en række case studies og praktisk
laboratoriearbejde, som samlet illustrerer hvordan morderne DNA
baserede metoder anvendes til analyse af fiskebestande. Genetiske
metoder anvendes til at definere forvaltningsområder, estimere
bestandsstørrelse, til identifikation af ulovligt fiskeri,
bevarelse of genetiske ressourcer og til genetisk monitering af
effekten af menneskelig aktivitet, såsom fiskeri, udsætning og
global opvarmning.
Kurset gennemgår basale koncepter indenfor populations-genetikken
om hvordan genetisk variation er fordelt mellem bestande.
Gennemgangen inkluderer en diskussion af hvordan selektion påvirker
bestandene og hvordan bestandene kan tilpasse sig til det lokale
miljø gennem evolution, såkaldt ”lokal tilpasning”. Diskussionen
vil blive integreret med klassiske begreber indenfor conservation
biologien, såsom minimums bestandsstørrelse for at undgå indavl,
tab af genetisk diversitet og evolutionært potentiale.
Den seneste udvikling indenfor genom forskningen vil blive
gennemgået med speciel fokus på fisk, hvilket giver hele nye
muligheder for at koble genernes funktion med fiskenes fysiologi,
adfærd og livshistorie. De forskellige emner vil blive integreret
gennem en evaluering af hvordan menneskelig miljøforandringer
påvirker bastandenes genetik og hvilken effekt forskellige
forvaltningstiltag såsom marine reservater kan have på fiskenes
genetiske diversitet.
De studerende vil blive bedt om at udvælge deres eget case studie,
som skal danne basis for en afleveringsopgave.
Mulighed for GRØN DYST deltagelse:
Kontakt underviseren for information om hvorvidt dette kursus giver
den studerende mulighed for at lave eller forberede et projekt som
kan deltage i DTUs studenterkonference om bæredygtighed,
klimateknologi og miljø (GRØN DYST). Se mere på http://www.groendyst.dtu.dk