2011/2012

27411 Biologisk dataanalyse og kemometri

Engelsk titel: 


Biological data analysis and chemometrics

Sprog:


Point (ECTS )


5

Kursustype:   

Civil- Videregående Kursus
Kurset udbydes under åben uddannelse


Skemaplacering:

F2A

 

Undervisningsform:

Forelæsninger, arbejde med PC (multivariate statistik programmer)

Kursets varighed:

13-uger

Eksamensplacering:

F2A,   E2A 

Evalueringsform:

Hjælpemidler:

Bedømmelsesform:

Tidligere kursus:

27511

Pointspærring:

Faglige forudsætninger:

,

Deltagerbegrænsning:

Minimum  15, Maksimum:  40
 

Overordnede kursusmål:

Efter kurset har du erfaring i at anvende de gængse kemometriske metoder, der bruges i alle biologiske og kemiske discipliner, hvor der bruges avanceret spektrometriske og andre fysiske/kemiske målemetoder. Kemometri bruges i stort og stigende omfang i grundvidenskabelige fag og industrielle virksomheder.


Læringsmål:

En studerende, der fuldt ud har opfyldt kursets mål, vil kunne:
  • Give en oversigt over vigtige kemometriske metoder.
  • Identificere situationer hvor man bør bruge eksplorativ dataanalyse.
  • Beskrive og bruge forskellige former for skalering, transformering og normalisering af data.
  • Forstå og beskrive forskellen mellem klassifikation og regression.
  • Forstå og beskrive forskellen mellem klustering og ordination.
  • Anvende og fortolke principal komponent analyse (PCA) på multivariate data.
  • Anvende og fortolke principperne i validering og outlier bestemmelse.
  • Bruge og fortolke kluster analyse på multivariate data.
  • Beskrive, anvende og fortolke multiple linear regression (MLR) og ridge regression (RR) og hvor disse metoder kan anvendes i to matrice problemer.
  • Beskrive, anvende og fortolke principal component regression (PCR) og partial least squares regression (PLSR) og hvor disse metoder kan anvendes i to matrice problemer.
  • Anvende og fortolke korrespondance analyse.
  • Beskrive metoden metrisk multidimensionel skalering.

Kursusindhold:

Multivariat behandling af kvantitative og kvalitative datamatricer. Eksplorativ dataanalyse, regressions- og klassifikations-metoder. Skalering og standardisering af rådata. Klusteranalyse og ordination (egenværdianalyser). Principal komponent analyse, principal komponent regression, partial least square regression, principal koordinat analyse og korrespondence analyse. Validering af data, specielt krydsvalidering og jack-knifing. Anvendelse af plots i evaluering af data. Specielle problemstillinger ved biologiske, bioteknologiske og kemiske data.


Mulighed for GRØN DYST deltagelse:

Kontakt underviseren for information om hvorvidt dette kursus giver den studerende mulighed for at lave eller forberede et projekt som kan deltage i DTUs studenterkonference om bæredygtighed, klimateknologi og miljø (GRØN DYST). Se mere på http://www.groendyst.dtu.dk/kursustilmelding.aspx


Kursusansvarlig:

Jens Christian Frisvad, 221, 204, (+45) 4525 2626, jcf@bio.dtu.dk  
Per B. Brockhoff, 305, 110, (+45) 4525 3365, pbb@imm.dtu.dk  

Institut:

27 Institut for Systembiologi

Deltagende institut:

02 Institut for Informatik og Matematisk Modellering

Tilmelding:

I CampusNet
Sidst opdateret: 15. april, 2011