At udvikle et kendskab til grundlæggende metoder og begreber inden for beregning af molekylers struktur, interaktion og dynamik. At introducere anvendelse af computerbaserede beregningsmetoder i kemi og biologi herunder lægemiddeldesign. Opnå erfaring med relevant computer software.
Læringsmål:
En studerende, der fuldt ud har opfyldt kursets mål, vil kunne:
Visualisere molekylstrukturer på basis af krystallografiske databaser
Beskrive fundamentale metoder til beregning af molekylers struktur og dynamik
Anvende disse metoder til forudsigelse af molekylers konformation
Anvende disse metoder til at beregne vekselvirkning mellem molekyler
Beskrive reaktionsmekanismer i organisk kemi på kvantitativt grundlag
Beskrive ”guest-host” vekselvirkning mellem biomolekyler på kvantitativt grundlag
Anvende relevant computer software
Demonstrere kendskab til computerbaseret lægemiddeldesign og dets rolle i moderne lægemiddeludvikling
Kursusindhold:
Introduktion til molekylmodellering og visualisering. Grundlæggende metoder til beregning af molekylers struktur og dynamik: Kvantekemi, molekylmekanik og molekylærdynamik. Eksempler på anvendelser: Konformationssøgning, reaktionsmekanismer i organisk kemi, enzym-substrat vekselvirkning. En række computerøvelser illustrerer anvendelser inden for organisk kemi, biokemi, og medicinalkemi herunder design af lægemidler.
Litteratur:
Noter udleveres
Bemærkninger:
Kurset kan også benyttes som en introduktion til "computational chemistry" for bachelorstuderende.
