At give de studerende en grundlæggende indføring i praktiske mikrobiologiske metoder, herunder relevante molekylære teknikker, til isolering, dyrkning, karakterisering og screening af mikroorganismer (bakterier og svampe). At introducere enkle molekylære metoder til diversitetsbestemmelse og til screening og gene-mining uden forudgående dyrkning af mikroorganismerne. Kurset er basalt og henvender sig til studerende uden større erfaring i dyrkning og håndtering af mikroorganismer.
Læringsmål:
En studerende, der fuldt ud har opfyldt kursets mål, vil kunne:
Skelne mellem bakterier og svampe og udarbejde strategier for at isolere disse.
Isolere og rendyrke almindelige bakterier.
Isolere og rendyrke almindelige skimmelsvampe.
Bestemme de isolerede bakteriearter.
Identificere de isolerede svampe til slægts og artsniveau.
Kunne anvende viden fra svampe- og bakterielitteratur.
Søge i specifikke molekylære databaser.
Håndtere og aligne mindre gensekvenser.
Konstruere enkle evolutionære træer.
Kunne rapportere resultater i et mindre projekt som et artikelforslag.
Kursusindhold:
Kurset omfatter øvelser samt et projekt udført i 3-4 personers grupper. I øvelserne introduceres og indøves basal isolering af bakterier og skimmelsvampe. Identifikation ved hjælp af fysiologiske og molekylære fylogenetiske metoder. Søgning i databaser. Konstruktion af evolutionære træer. I projektet foretages selvstændigt arbejde i grupper med screening, isolation og identifikation af mikroorganismer fra naturlige og tekniske miljøer. Projektet kan også omfatte diversitetsundersøgelser, gene-mining, og emner relateret til den humane mikrobiota. Projektet vælges ud fra en række tilbudte emner.
