At give de studerende en basal indsigt i den funktionelle diversitet og arts diversiteten af mikroorganismer (bakterier, archaea og svampe) med henblik på en forståelse af deres positive og negative roller i det omgivende miljø – herunder mennesket, og på en optimal udnyttelse af deres egenskaber til bioteknologiske formål. Udover et bredt kendskab til relevante mikroorganismer inkluderer kurset arbejde med fundamentale biologiske begreber, der er af stor værdi for alle bioteknologiske, medicinske, levnedsmiddelteknologiske, molekylære og mikrobiologiske fag.
Læringsmål:
En studerende, der fuldt ud har opfyldt kursets mål, vil kunne:
Give et overblik over mikroorganismernes evolutionære diversitet.
Give et overblik over mikrobiel fysiologisk diversitet.
Redegøre for problemerne, der knytter sig til klassifikation og artsbegreb hos mikroorganismer.
Redegøre for mikrobielle interaktioner.
Redegøre for basal mikrobiel økologi.
Beskrive kommercielt vigtige mikroorganismer.
Vurdere konventioner, der regulerer kommerciel udnyttelse af mikroorganismer.
Beskrive forskellige screeningsmetoder for nye mikroorganismer.
Beskrive hvordan gener med interessante egenskaber kan isoleres fra naturlige miljøprøver.
Redegøre for basal bioinformatik, som bruges til håndtering af mikrobiel biodiversitet.
Kursusindhold:
Overordnet gennemgang af den mikrobielle diversitet, som foregår ved at belyse de fylogenetiske, taxonomiske og fysiologiske ligheder og forskelle mellem bakterier, archaea og svampe - med fokus på de bioteknologisk og medicinsk interessante mikroorganismer. Følgende områder vil herunder blive behandlet: • Artsbegrebet. Evolutionært betinget klassifikation. Beskrivelse af nye arter. Phylogeni vs. klassisk taxonomi. • Vigtige grupper af bakterier, archaea, og svampe og deres metabolisme. • Gennemgang af biodiversitet fra individ til økosystem. Mikrobiel økologi. • Isolering og identifikation af mikroorganismer og screening for ønskede egenskaber. • Mikroorganismers ernæringsmæssige krav. Design af isoleringsmedier. Biokonsortier, habitater, inkuberingsbetingelser, stammesamlinger. • Bioteknologisk udnyttelse af mikrobiel biodiversitet • Bioinformatik i relation til biodiversitet. IT og databaser.
