At give deltagerne basisviden om proteiners opbygning og struktur samt validering af proteinstrukturer. At give kendskab til og praktisk erfaring i krystallisering og røntgenstrukturbestemmelse af proteiner.
Læringsmål:
En studerende, der fuldt ud har opfyldt kursets mål, vil kunne:
bedømme og kritisere kvaliteten af en publiceret proteinstruktur
samarbejde omkring løsning og beskrivelse af en proteinstruktur samt beskrive den i en rapport
redegøre for symmetrielementerne i proteinkrystaller
redegøre for grundlæggende diffraktionsteori
definere det reciprokke gitter og relatere det til det direkte gitter
redegøre for hvordan en optimal dataopsamling foregår
forklare hvordan en proteinstruktur løses ved hjælp af isomorf erstatning eller anomal spredning
forklare hvordan en proteinstruktur løses ved hjælp af molekylær erstatning
montere en proteinkrystal på et diffraktometer
opsætte et krystallisationsforsøg
Kursusindhold:
Primær, sekundær, tertiær og kvarternær struktur. Fundamental symmetrilære, herunder symmetrioperationer, krystalsystemer og rumgruppenotation. Eksperimentelt arbejde med krystallisering og test af krystalkvalitet. Løsning af proteinstrukturer ved forskellige metoder. Brug af databaser. Strukturvalidering og læsning af strukturartikler.
