2008/2009

10352 Modellering af komplekse biologiske systemer

Engelsk titel: 


Modeling of Complex Biological Systems

Sprog:


Point (ECTS )

  5

Kursustype:   

Civil- Videregående Kursus
Kurset udbydes under åben uddannelse


Skemaplacering:

E3A

 

Kursets varighed:

13-uger

Evalueringsform:

Hjælpemidler:

Bedømmelsesform:

Tidligere kursus:

10343

Pointspærring:

Faglige forudsætninger:


Overordnede kursusmål:

Kurset giver en general introduktion til formuleringen af proces-orienterede modeller af fysiologiske kontrolsystemer. Vægten vil blive lagt på beskrivelsen af mekanismer der genererer komplekse ikke-lineære dynamiske fænomener: Selvstændige oscillationer, spiking og bursting, synkronisering, bølger og mønstre.


Læringsmål:

En studerende, der fuldt ud har opfyldt kursets mål, vil kunne:
  • Anvende bevarelsesbetingelser og kausalitetsbetragtninger i beskrivelsen af biologiske systemer.
  • Bestemme ligevægtspunkter samt stabilitets- og bifurkationsbetingelser for simple biologiske reguleringssystemer.
  • Opstille populationsmodeller af relevans for immunssystemets respons på forskellige udfordringer.
  • Opstille modeller af lægemidlers absorption, fordeling i kroppen, nedbrydning og endelige udskillelse.
  • Modellere koblingen mellem iltoptagelsen og kuldioxid udskillelsen i lungerne.
  • Beregne nyrenefronernes glomerulære filtration og beskrive den tubuglomerulære tilbagekobling.
  • Konstruere en model af resorptionen af vand og salte i Henles slynge.
  • Analysere bifurkationsfænomener i den elektrofysiologiske aktivitet i forskellige nerve-, kirtel- og muskelceller.
  • Konstruere simple modeller af synkroniseringsfænomener i systemer af lokalt eller globalt koblede celler.
  • Beskrive stokastisk resonans i exciterbare celler.

Kursusindhold:

Mekanisme-baserede biologiske modeller. Immunsystemets respons på en infektion. Insulinabsorption fra underhuden. Testprocedure for nye insulinvarianter. Cellulær dynamik: exciterbarhed, spiking og bursting, respons på ekstern støj. Nerveceller, temperatur receptorer, insulinproducerende celler i bugspytkirtlen. Cellulær kommunikation: calcium induceret calcium frigivelse, gap-junctions, intercellulære Ca2+ bølger. Glatte muskelceller; vasomotion; signaludbredelse i hjertet. Pulserende hormonfrigivelse: Insulin. Tryk og flowregulering i nyrenefronerne. Vekselvirkende nefroner. Kontrol af det menneskelige respirationssystem. Udveksling af O2 og CO2 i lungerne. Form- og mønsterdannelse i biologiske systemer.


Kursusansvarlig:

Erik Mosekilde, 309, 121, (+45) 4525 3104, erik.mosekilde@fysik.dtu.dk  

Institut:

10 Institut for Fysik

Nøgleord:

Dynamiske systemer, instabiliteter og strukturer i væskestrømninger, biologiske modeller, kaos.
Sidst opdateret: 9. juni, 2008