Kursets overordnede mål er at give de studerende en grundig gennemgang af forskellige metodikker for biofilmdyrkning og analyse. Deltagerne vil desuden have opnået kendskab til den generelle fysiologi af bakterier, der vokser som biofilm og specielle problemstillinger i forbindelse med behandling af patienter, der er inficeret med bakterier, der vokser som biofilm.
Læringsmål:
En studerende, der fuldt ud har opfyldt kursets mål, vil kunne:
Opstille biofilm flowcelle forsøg og udføre disse: Manipulation og monitoring af levende biofilm, antibiotika behandling af biofilm, viabilitetsmåling, on-line measurements af ilt i biofilms, høstning af biofilm.
Udføre biofilm mikrotiterbakkeassay.
Anvende avancerede optiske mikroskopiteknikker: Konfokalmikroskopi og fluorescensmikroskopi, time-lapse (konfokal) mikroskopi.
Anvende Atomic force microscopy til nanoskala-afbildning.
Anvende flowcytometri til enkelt-celle analyse.
Udføre matematisk billedbehandling ved COMSTAT-analyse.
Forstå Cellstat-analyse.
Udføre digital billedpræparation og præsentation (Imaris).
Præsentere biofilm resultater for en forsamling.
Kursusindhold:
Kurset er fokuseret på biofilm i en medicinsk kontekst med eksempler fra urinvejsinfektioner til cystisk fibrose. Teknikkerne inkluderer opsætning og kørsel af biofilm-flowcellesystemer, fluorescence in situ hybridization, forskellige former for avancerede afbildningsformer, flowcytometri med mere. Kurset vil være delvist praktisk med øvelser suppleret med forelæsninger af fremtrædende forskere inden for felterne medicinsk mikrobiologi og mikrobielle biofilm.
Bemærkninger:
Kursusgebyr DKK 5.000 for deltagere fra academia DKK 10.000 for deltagere fra industrien Gebyret dækker ikke ophold eller fortæring.
