Efter kurset vil den studerende være i stand til at læse og fremlægge videnskabelige artikler, omhandlende avancerede globale, intracellulære reguleringsnetværk, med inddragelse af relevant baggrundslitteratur. Den studerende vil kunne genkalde sig en række af de mest almindelige paradigmer for global regulering, og vil uden hjælpemidler kunne give en overordnet beskrivelse af de centrale molekylære mekanismer, såsom repressorer, aktivatorer, attenuatorer og brugen af en alternativ Sigma faktor. Dette vil også inkludere en viden om hvad der anvendes som den kontrollerende faktor. Desuden vil den studerende kunne koble sin viden om reguleringssystemer sammen med sin viden om cellens basale metabolisme: Med udgangspunkt i en given organisme og givne vækstbetingelser vil der ved hjælp af målrettet litteratursøgning kunne opstilles hypoteser om effekten af forskellige reguleringssystemer på cellens metabolisme.
Kursusindhold:
Kurset er bygget op på gennemgang af review- og forskningsartikler omhandlende primært globale reguleringssystemer, samt diskussioner af reguleringssystemets relation til den mikrobielle metabolisme. Der vil blandt andre blive gennemgået følgende bakterielle systemer: Heat shock regulering (HrcA/CIRCE, Sigma 32), osmo-regulering (EnvZ), oxidative/anaerob stress regulering (OxyR, SoxR), stringent (ppGpp/RelA) regulering, DNA damage (SOS) respons, nitrogen regulering (NTR/ Sigma 54), catabolit regulering (CRP, CcpA), nukleotid regulering (PurR, PyrR).
Hver undervisningssession vil bestå af fremlæggelse af reviewartikler i samarbejde mellem lærer og fremlæggelsesgruppe, efterfulgt af præsentation af forskningsartikel ved fremlæggelsesgruppen. Uddybende spørgsmål bliver herefter af evalueringsgruppen stillet til fremlæggelsesgruppen og til tilhørerne. Hver session afsluttes af lærerne med en afrunding. I slutningen af kurset skal hver gruppe udfærdige en poster over et selvvalgt emne indenfor global regulering. Denne poster, som udfærdiges af en gruppe på 2 personer, skal beskrive et eller flere regulatoriske systemer, samt interaktion mellem reguleringssystemerne og den cellulære metabolisme under specifikke omstændigheder.
