At sætte de studerende i stand til at skrive simple Perl programmer i et Unix environment for at løse mindre bioinformatiske opgaver, f.eks. i forbindelse med projektarbejde.
Kursusindhold:
Man lærer at begå sig i et UNIX miljø med de mest almindelige kommandoer. Filhåndtering på kommandolinie, omdirigering af I/O. I Perl læres at konstruere programmer med god programmeringspraksis, diverse løkkestrukturer, tabeller, regulære udtryk, samt mere avancerede datastrukturer. De mest almindelige bioinformatiske databaseformater, samt hvordan man parser (læser) dem demonstreres. Computerøvelser er integreret med forelæsningerne og tæller 5% af den samlede bedømmelse. Den skriftlige eksamen tæller 75%, hvor en afløsningsopgave undervejs i kurset tæller 20%.
