Proteiners tredimensionelle struktur og fleksibilitet bestemmer deres funktion i biologiske processer. Kendskab til proteiners struktur udnyttes bl.a. til systematisk design af lægemidler og optimering af biokatalysatorer. Målet med de senere års ”structural genomics” projekter er at kortlægge foldningsrummet, så det på længere sigt bliver muligt at generere en brugbar homologimodel af et hvilket som helst protein. På kurset vil de studerende analysere proteinerne fra fugleinfluenza, hvor de vil undersøge de molekylære mekanismer der ligger bag de forskellige faser i virusens cyklus. Derved får de studerende en dybere forståelse for proteinstrukturanalyse samt kendskab til de nyeste teknikker indenfor homologimodellering, ”protein engineering” og ”directed evolution”.
Kursusindhold:
Proteiners struktur fra primær til kvaternær, eksperimentel bestemmelse af proteinstruktur, ”structural genomics”, forudsigelse af sekundærstruktur, overfladetilgængelighed m.m., ”fold recognition”, homologimodellering, strukturvalidering, proteinstrukturanalyse, ”protein engineering”, ”directed evolution”.
