At forstå funktion samspillet mellem mange forskellige processer i biologiske systemer og hvordan man kan foretage kvantitative og kvalitativ modellering betragtninger af disse systemer.
Kursusindhold:
Definering af biologiske systemer. Beskrivelse af nogle relevante biologiske systemer såsom cellefabrikker, humant væv og forskellige modelsystemer. Modelleringsprincipper, first principle versus data-drevne modeller. Brug af maskinindlæring i forbindelse med modellering, neurale netværk og skjulte Markov modeller. Metabolske netværk og kvantitativ beskrivelse af disse. Grafteori og elementary flux modes. Netværksstrukturer og deres robusthed. Kinetikmodeller for enzymatiske reaktioner og for signaltransduktionspathways. Hiarakisk kontrol. Protein-protein vekselvirkningsnetværk. Globale interaktionsnetværk og analyse af disse. Pathway rekonstruktion. Data- og modeldrevne analyser af transkriptions-, proteom- og metabolomedata.
