At give den studerende overblik over og indsigt i de bioinformatiske værktøjer der anvendes i biologisk og medicinsk forskning, samt at sætte den studerende istand til at løse avancerede bioinformatiske opgaver.
Kursusindhold:
Forudsigelse af proteiners struktur, funktion, modifikationer og lokalisering. Forudsigelse af post-translationelle modifikationer såsom proteolytisk kløvning, glykosylering og fosforylering. Lokaliseringssignaler. Foldningsklasser, sekundærstruktur forudsigelse, genkendelse af fold, proteinstruktur alignment, homologi. Nukleotid og aminosyre sekvenser: multiple alignment, databasesøgning, genfinding, phylogenetisk rekonstruktion. Strukturelle egenskaber af DNA. Værktøjer til forudsigelse: Skjulte Markov modeller og kunstige neurale netværk. DNA microarrays: analyse af DNA microarray data inklusive normalisering, signifikans, clustering, principal component analyse, reverse engineering af regulatoriske netværk, klassificering og promoteranalyse. Computer øvelser er integreret med forelæsningerne.
