2004/2005

27613 Perl og Unix for bioinformatikere

Engelsk titel: 


Perl and Unix for Bioinformatics

Sprog:


Point (ECTS )

  5

Kursustype:   

Kursus for civilingeniørstuderende-
Kursus for Ph.d.-studerende-
Kurset udbydes under Tompladsordningen


Skemaplacering:

F2A

 

Undervisningsform:

Forelæsninger og computerøvelser

Kursets varighed:

13-uger

Eksamensplacering:

F2A 

Evalueringsform:

Varighed eksamen:

Hjælpemidler:

Bedømmelsesform:

Pointspærring:

Deltagerbegrænsning:

Minimum  12, Maksimum:  30
 

Overordnede kursusmål:

At sætte de studerende i stand til at skrive simple Perl programmer i et Unix environment for at løse mindre bioinformatiske opgaver, f.eks. i forbindelse med projektarbejde


Kursusindhold:

Man lærer at begå sig i et UNIX miljø med de mest almindelige kommandoer. Filhåndtering på kommandolinie, omdirigering af I/O. I Perl læres at konstruere programmer med god programmeringspraksis, diverse løkkestrukturer, tabeller og regulære udtryk. De mest almindelige bioinformatiske databaseformater, samt hvordan man parser (læser) dem demonstreres. Computerøvelser er integreret med forelæsningerne og tæller 5% af den samlede bedømmelse. Eksamen tæller 95%.


Kursusansvarlig:

Peter Wad Sackett, 208, 020, (+45) 4525 2427, pws@cbs.dtu.dk  

Institut:

27 BioCentrum-DTU

Kursushjemmeside:

http://www.cbs.dtu.dk/courses/27013
Sidst opdateret: 19. oktober, 2004