Aftales med læreren
Ingen eksamen i den ordinære eksamensperiode
Evalueringsform:
Bedømmelsesform:
Pointspærring:
Faglige forudsætninger:
Ønskelige forudsætninger:
Deltagerbegrænsning:
Minimum 10, Maksimum: 60
Overordnede kursusmål:
DNA microarray teknologien spiller allerede nu en afgørende rolle indenfor mikrobiologien, bioteknologien og lægemiddelforskningen. Kursets mål er at give de studerende et generelt kendskab til de forskellige metoder der findes til ekspressionsanalyse samt et indgående kendskab til computerbaseret analyse af data genereret ved ekspressionsanalyse. De studerende vil, ved hjælp af øvelser, blive sat i stand til selv at foretage videregående computerbaseret analyse af resultater fra DNA chip eksperimenter.
Kursusindhold:
Teknologien bag oligonucleotid arrays, cDNA arrays og Serial Analysis of Gene Expression (SAGE). Normalisering af data før sammenligning mellem forsøg. Statistik signifikans af ændringer. Reduktion og visualisering af store datamatricer: PCA, clustering. Reverse engineering af regulatoriske netværk. Molekylær klassificering. Promoteranalyse og funktionsanalyse. Integrering af data. Case stories ved gæsteforelæsninger og fremlæggelser af de studerende. Afsluttende rapport over komplet selvstændig analyse af datasæt.
