Aftales med læreren
Ingen eksamen i den ordinære eksamensperiode
Evalueringsform:
Hjælpemidler:
Bedømmelsesform:
Faglige forudsætninger:
,
Ønskelige forudsætninger:
Deltagerbegrænsning:
Minimum 10, Maksimum: 30
Overordnede kursusmål:
At give den studerende et omfattende kendskab til molekylær evolution (dvs evolutionen af DNA, RNA og proteiner). Specielt er det målet at give den studerende både erfaring i, og teoretisk forståelse af, modelbaserede metoder til at rekonstruere fylogenetiske træer og teste hypoteser om den evolutionære proces. Selvom molekylær evolutionær analyse kræver en del matematisk forståelse, er det i høj grad tilstræbt at studerende som retter sig mere mod biologisk forskning også skal kunne deltage.
Kursusindhold:
Kort introduktion til grundlæggende evolutionsteori og populationsgenetik. Kort introduktion til grundlæggende sandsynlighedsregning og til relevante matematiske metoder. Drivkræfterne bag molekylær evolution. Modeller for DNA- og protein-substitution. Rekonstruktion af fylogenetiske træer ved hjælp af afstandsmetoder, parsimoni, maximum likelihood og Bayesiansk analyse. Avancerede nukleotid-substitutionsmodeller (gammafordelte mutationsrater, molecular clock modeller, codon-modeller og analyse af selektivt pres). Statistiske tests af evolutionsbiologiske hypoteser(likelihood ratio tests, parametrisk bootstrapping, Bayesiansk statistik).
En del af emnerne vil blive yderligere belyst ved fremlæggelser af de studerende og ved gæsteforelæsninger. Desuden vil de studerende opnå praktisk erfaring i at benytte computermetoder ved selv at analysere sekvenser fra den videnskabelige litteratur, herunder specielt data relateret til viral evolution.
